工程结算审计是对工程结算的真实性、合法性和效益性进行的审查和评价，是促进企业加强审计监督，真实反映工程造价，保证资金合理使用和工程质量，有效控制建设投资的重要手段。
工程结算审计的第一依据是施工合同，把握合同的要点，对于工程结算审计的准确性是十分重要的。对照合同，主要审核内容包括是否具备办理竣工结算的条件；合同工期、质量、违约责任等条款是否完全履行；合同约定的结算方式以及合同价款的调整因素是否与投标文件承诺相符；合同结算条款是否贯彻执行等等。工程量是工程造价计算的基础，工程量的真实性和准确性对工程造价的影响很大。在审核工程量时，首先应熟悉施工图纸和工程量计算规则，全面了解工程变更签证情况，并按现场查勘表进行仔细核对。内审人员尤其要对工程投资有重要影响的项目，如土石方、地基、围护结构等工程量进行重点核查，审核工程量有无多计、重计或漏计以及计算单位是否一致。要特别关注隐蔽工程的工作量。定额套用是否合规、合理和准确，直接影响单价的高低。审核定额子目选用是否合规、恰当，有无高套、重套或多套现象；人工、材料、机械单价是否与合同约定计价一致；定额换算是否合规，换算方法是否合理和准确，是否存在不按定额综合解释和换算系数换算等情况。审核各项费用是否按照相应文件进行计算；工程类别划分是否正确；工程取费是否按照相应计算基数和费率标准执行，利润和税金的计算基数、利润率、税率、安全文明措施费率是否符合规定；材料是否按合同规定计价；单价下浮或总价下浮计算是否正确；在结算中是否存在应扣未扣的费用，如预付款、代购材料设备款、质量工期罚款等。材料费是工程造价的一大组成部分，一般占到工程造价的60%左右。随着国家供给侧改革以来，环境保护政策越来越严格，改革对钢材、水泥等大宗物资产能的影响巨大，导致建材价格变动很大。审计时应根据合同约定调整材料的种类、风险幅度和调整方法等条款，结合相关政策文件、材料价格市场调查信息、发票单据、购销合同等，复核计算材料用量，确认材料市场价或物价指数，审核材料差价金额。根据实务经验，签证占原合同额的比例较大，对签证的审核往往是各方争议的焦点。对于现场签证的审核，应遵循客观、公正的原则。审计前应熟悉所审计项目有可能存在的变更签证项目，熟悉所审计项目承包合同中对洽商变更签证事项的约定条款。要求提供的签证信息应真实、完整和准确，签证原因、工程量计算表、金额计算表等资料齐全，签证证据中还应包含现场图片或视频资料，图片及视频资料要保留日期设置、有明确的参照物。审核签证部分是否属于施工方应承担的风险，甄别无效签证；签证部分是否已扣除相关费用；签证的真实性、合理性与有效性，对于不合理的情况，应大胆质疑，小心求证，现场踏勘和测量，询问相关人员，核实相关资料。对于签证的审计一定要关注手续、程序，不仅要审查有无承发包双方、监理的签字，还要审查签字的真实性、程序的合规性和有效性。
一是全面审计法。
按现行工程定额顺序、施工顺序或竣工图纸顺序，对全部项目逐一进行审查的方法。优点是全面、细致、质量比较高，缺点是工作量较大、审查时间长。
二是对比审计法。
是用已建成工程预算或建成但已审查工程预算对比拟建同类工程的方法。
三是重点审计法：
是对工程结算的重点进行审查的方法。一般指工程量大或造价高的工程结算，包括补充合同、估列工日的各项费用的审查。
四是运用建筑信息模型（BIM）分析法。
是指在规划设计、建造施工、运维过程的整个或某个阶段，应用多维信息技术，进行系统设计、协同施工、虚拟建造、工程量计算、造价管理、设施运行的技术和管理手段。
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