如何快速了解一个人体基因的所有信息 (二)

昨天我们介绍了GeneCards可以查询的一部分功能 如何快速了解一个人体基因的所有信息 (一)，还有一些没有介绍的，今天我们继续介绍完哈！

PART 4

基因功能

上面对于基因的介绍是它本身在染色体上的基本特征,了解了基本特征，我们还要进一步的去了解这个基因有什么功能,毕竟功能决定这个基因的研究价值的。GeneCards方面，对于基因功能的注释包括了包括了：Localization、 Pathways、 Function。

Localization

一个基因的功能经常是由他们的定位决定的，基因在细胞核和细胞质形式的功能不一样的，所以我们就把基因的定位放到基因功能上了。GeneCards对于基因功能的定位使用的是compartments、HPA数据库。另外关于GO数据库，也提供了细胞组分的分类，所以GeneCards把关于这个基因的go的信息也就纳入进来了。

Function

提到GO数据库的话，这个数据库还提供了其他两种信息，另外的分子功能就直接放到的功能这个部分了。

Pathways

对于一个基因而言，他的功能也是通过相关的信号通路来发挥作用的。GeneCards收集了目前主流的一些数据库关于这个基因的信号通路信息，例如: KEGG、Reactome等等。在这里，我们就可以了解到很多关于基因通路的信息。

PART 5

基因和临床的相关性

由于我们做的很多基因相关的研究是要来解释疾病的发生原理的，所以往往还是要看这个基因和疾病的相关性。GeneCards提供了两个和疾病有关的模块，分别是：Disorders和Drugs。

Disorders

在Disorders这个模块下，汇总了这个基因和哪些疾病是有关系的。当然这种的汇总是基于以往的研究来的，所以如果没有看到和我们研究的疾病有关系，那也不一定说明真的是没关系，这里的数据主要来自于malacards。关于malacards的介绍，我们明天再说。

Drugs

药物在体内发挥作用也是需要通过基因的变化来产生的，所以我们可以通过这个模块了解有哪些药物影响这个基因的表达。数据库总结了DrugBank，ClinicalTrials，ApexBio，DGIdb和Novoseek五个数据库的结果，我们可以很容易的看到这个基因的和哪些药物有关系以及可能的激活机制。

PART 6

相似基因

有时候我们除了了解了这个基因的功能本身的功能之外，还想要研究这个基因在不同物种的进化关系，以及相同物种这个基因和哪些基因相似，这个在数据库也是有的Orthologs、Paralogs。

• 我们可以在Orthologs查看，不同物种之间相同基因之间的相似度。

• 可以在Paralogs查看，这个基因和其他哪些基因高度同源。

PART 7

目前发表的文章

研究完基因的功能之后，最后还是要看这个基因一共发表了多少篇文章的。这个可以看见Publications当中看到，检索的是所有相关的文章。我们可以在进一步检索当中输入关键词，查看和某一个疾病相关的研究都有多少篇。

数据库总结

对于基因的研究在这个数据库已经汇总的很多了。而且对于一个刚刚入科研门槛的人，如果不清楚基因研究都研究那些方面，那如果能把这个数据各个方面都弄懂的话，也不失为一种入门的方法。这两天我们对于GeneCards的介绍就到这里，明天我们来介绍一下综合性查询疾病相关信息的数据库: MalaCards。