从ncRNA-eQTL谈重复性工作代码的重要性 2024-04-21 14:27:13 数据库介绍本来进行时打算介绍 ncRNA-eQTL(http://ibi.hzau.edu.cn/ncRNA-eQTL/)数据库,但是打开数据库的时候,发现数据库的界面是这样的。当时就感觉这个页面怎么这么熟悉,看着标题,怎么感觉和之前介绍的SNP2APA数据时一样的感觉。所以后来就断定了这应该是一个团队做出来的了。后来又去查了查相关的文献,那就基本上是一个团队写了的。不由得十分佩服,20年的年初就两篇十分文章到手,也是很是开心的呀。所以对于 ncRNA-eQTL 数据的介绍,也就基本上没有什么介绍的了。所有基本的使用方法,以及对于QTLs的介绍可以详见另外的那个帖子。我们其实只需要知道说:这个数据库利用TCGA的数据构建的,其可以用来查找SNP对于ncRNA(lncRNA以及miRNA)表达调控的影响。如果需要用到的可以来这个查找相关的信息,可以使用这个数据库。絮絮叨叨由于这个帖子对于数据库的介绍,如此的短,所以我扯点儿别的,通过上面的两个文章见到的来说一下在重复性工作当中代码中重要性。我们公众号成立的目的其实主要还是想给大家介绍一些目前网上他人发表的的数据库,这样对于不会编程的科研工作者来说,可以更好的利用高通量测序的一些结果,进而更加方便大家进行科学研究。出于这样的目的,我们也一直在避免给大家介绍关于一些编程代码相关的东西。但是,有时候总是会发现学习一些代码的必要性。代码化的工作或者处理数据可以更加的效率工作。就比如我要在word里面打两篇内容相似,只是中间有一些词语微调的文章,我们要做的肯定是打出其中一篇,然后把这一篇复制+粘贴,然后微调另外一篇文章。肯定不会有人打完一篇文章,再从头再打第二篇的吧?这个只是简单的办公小技巧,很多时候使用代码编程起到就是减少重复性工作的目的。拿👆两个差不多的数据库而言。一个网页形式的数据库的就是用编程代码来进行写出来的,由于两个数据库基本布局都差不多了,所以构建布局的代码都差不多。由于算法用的也是一样的,所以算法的代码其实也是基本没变的。主要的区别还是在于两个数据库使用的数据不一样(一个使用的是ncRNA的数据而另外一个使用的则是APA事件的数据)。由于主要分析和页面的代码基本都差不多,这个也就造就了,可以很快而且几乎都同时在一个杂志上发表两篇数据库文章。既然代码这么方便,那推荐学嘛?这个得看人,我们一般把编程工具叫做什么语言,比如R语言、python语言、C语言等等。既然叫做语言了,那其实就是和类似于英语一样的。大家对于英语的学习难道是一两天能学会的?完全都是靠时间慢慢的堆出来的。所以如果有精力的情况下,可以试着去学一下试试,觉得感兴趣可以继续学下去。要是没有精力,那就算了。现在社会是一个合作性的社会,并不一定要样样精通的。作为一个临床医生,有临床信息和样本;作为基础科研工作者,可以进行下游的基础实验,利用自己的优势和其他编程的人合作就可以的。所以为什么一定要学编程呢?好了,今天就絮叨到这里。如果哪天有帖子还是短了,可以在和大家絮叨絮叨别的东西。 赞 (0) 相关推荐 【生信挖掘】浅谈生信入门学习知识 生信已经成为科研圈发SCI的神器了,检索PubMed上可见发表的文章不管高分低分都涉及生信,甚至南通大学2016级临床本科生张波发表21篇SCI,从影响因子 15分(2020年发表,实时IF 26分) ... Nat Chem|化学机器学习的最佳实践:推荐的一套标准化指南 2021年6月,来自哥伦比亚大学的Nongnuch Artrith等人在Nature Chemistry上合作发表评论,为化学机器学习训练和报告的标准化推荐了一套指南. 以下是全文内容. 摘要 基于机 ... Python和ArcGIS自动化制图完全指南:前言 v3 前言:下文以<指南>代替本系列文章名称.在该指南中,我们将手把手的讲解如何使用 Python(ArcPy) 这门编程语言实现 ArcGIS 自动化的更新制图等操作.在学完所有文章后,读者可 ... 谈班主任工作 一.做好学生思想动员工作,我主要从以下方面着手: 1.让每一个学生明确学习目的. 是什么改变命运?权力?金钱?父母?我告诉每一位学生,"知识改变命运",拥有的知识越多,改变命运的机 ... 【173】浅谈班主任工作 前言:2012年10月走进爱物学校至今,已经不觉走过了五个年头,当班主任也有四年,仔细想来,应该要梳理一下自己在担任班主任期间在班级管理以及语文教学上的一些想法和做法,其实二者相辅相成,并未分开过.愿 ... 汪诘杂谈 | 史上最难毕业季:汪诘谈找工作的科学 又到了毕业季,在以往的很多毕业季,都会看到有文章说这是"史上最难毕业季",这个"难"当然指的是找工作难.今年的毕业季,又成了"史上最难".不 ... 7 个必学的表格函数技巧,让你少做 80% 的重复性工作 日常办公时,我们经常会用表格处理数据.虽然能掌握基础的操作,但是涉及「函数」时,很多人就开始头疼了. 毕竟在实现精通 Office 的路上,函数一直都是绕不过的一道坎. 今天,WPS君就给大家整理了「 ... 用四个字谈办公室工作,概括精准、有内涵 今天 党委办公室作为党委的参谋部和中枢神经,对干部的素质要求很高.做好新形势下的党委办公室工作,开创党委办公室工作的新局面,必须进一步转变干部的思想观念,全面提升干部的业务素质,努力改进干部的工作作风 ... 谈班主任工作的“细” 班主任工作的艺术是什么?我以为是"细"的艺术.班主任工作不可能惊天动地,不可能有什么大事:如果有,那可能就是出"事故"了.因此,班主任工作讲究的就是一个&quo ... 市委书记在环保督察问题整改约谈暨工作推进会上的讲话:环保督察问责人数 时间:2020-07-28 20:12:07来源:百花范文网本文已影响55人市委书记在环保督察问题整改约谈暨工作推进会上的讲话 同志们: 今天会议,既是省环保督察问题整改集体约谈会,又是整改落 ... 浅谈安全工作的重要性(值得品读传播) 安全既是人生的责任,又是家庭.社会的大计!没有安全,生活就存在隐患:没有安全,家庭就没有幸福:没有安全,集体就没有秩序,工作无法开展.安全是生命的壁垒,是事业的起点.珍爱生命,保护生命,成就生命 ... 浅谈在工作中的“不可或缺”与“可以替代” 对于每个职场人来说,自己在工作中的价值十分重要.然而,是做到"不可或缺"还是"可以替代",这里边的学问不少. 很多人都会觉得"不可或缺"比& ...