植物TALENs基因编辑技术原理
类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALENs)是一种多功能的基因组编辑工具,已在植物基因功能研究和育种中得到了广泛的应用。与锌指核酸酶(zinc finger nucleases,ZFNs)相比,该技术具有脱靶率低和细胞毒性低的优点,TALENs采用简单的蛋白质- DNA识别机制。
TALENs由DNA结合域和具限制性内切酶活性的FokI组成(图1)。DNA结合域通常由1.5-33.5个串联重复序列组成。每个重复序列包含34个氨基酸,其中第12和第13个氨基酸为可变的,称为“重复可变双残基”(repeat variable diresidues,RVDs),它们可特异性地识别一个核苷酸。简而言之,RVDs的解码机制是NI (Asn Ile)、HD (His Asp)、NN (Asn Asn)和NG (Asn Gly)可分别识别A、C、G、T(图1)。由FokI组成的DNA切割域通常以二聚体的形式行使功能,且可切割序列从而造成DNA双链断裂。断裂的DNA双链一般通过非同源末端连接或同源重组修复两种方式进行修复,修复过程中会在断裂位点产生不同形式的突变:如点突变、缺失、插入、倒置、复制和易位等。
图 1. 类转录激活因子效应物核酸酶的结构(Wei et al., 2013)。
实验流程:
参考文献:
Wei C.; et al. (2013). TALEN or Cas9 – Rapid, efficient and specific choices for genome modifications. Journal of Genetics and Genomics 40 (6): 281-289.