The ISME Journal | 北冰洋SAR11细菌的多样性和生物地理学
推荐:江舜尧
编译:Frank
编辑:十九
加拿大康考迪亚大学生物系David A. Walsh等人于2019年9月9日在The ISME Journal发表题目为《Diversity and biogeography of SAR11 bacteria from the Arctic Ocean》的文章,该文章首次在基因组水平对SAR11菌群进行研究,为中生代生态型的存在提供了支持。
文章摘要
文章中重要图片说明
图1 | 研究元数据和SAR 11的系统发育概况。
a.西北冰洋宏基因组的取样位置。
b.取样位置环境概况:温度,盐度,叶绿素a荧光和硝酸盐。
c.包括北极样品和参考序列的ITS系统发育。
图2 | SAR11种系型在北冰洋的分布。
a.样本中北极SAR11种系型ITS区域覆盖度。
b.基于不同ITS种系型覆盖度的北极样本Bray-Curtis相异度主坐标分析。
图3 | 北极SAR11 MAGs的系统发育环境和分布。
a.基于39个直系同源基因座的最大似然系统发育。
b.覆盖西北极海洋宏基因组的北极MAG覆盖度。
图 4 | SAR11基因组的全球生物地理学。
a.海洋层和海洋区域的北极MAG和参考基因组的RPKG表。
b.基于北极MAG和参考基因组的RPKG值的宏基因组样本Bray-Curtis相异性的主坐标分析。
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