组合多个GSE数据集进行meta分析不妨先去冗余

发现一个工具,发表在 BMC Bioinformatics201415:323 https://doi.org/10.1186/1471-2105-15-323,很简单的设计,就是考虑到做多个GSE数据集的meta分析的人越来越多了,但是很多人都瞎搞,整合数据集的时候没有去冗余。

所以作者开发这个R包: DupChecker: a bioconductor package for checking high-throughput genomic data redundancy in meta-analysis

既然是R包,那么学习起来就很容易了。

meta分析都想做,结果第一步就失策,哈哈,反思一下!

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我的领域最出名的GSE数据集的meta分析应该就是2011年的TNBC了,如下:

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