【求助】用茎环引物逆转录miRNA,茎环引物的浓度是多少?

如题,我用自己设计的引物做茎环PCR检测某个miRNA,现在做逆转录这一步了,我用的是TAKARA的逆转录试剂盒做的,反应条件如下:
①5×PrimeScript Buffer 2.0μl
②PrimeScript RT Enzyme Mix I 0.5μl
③RT Primer Mixture 0.5μl
④Random 6 mers 0.5μl
Total RNA 500ng
⑤Rnase Free dH2O up to 10μl
※混匀后放入 PCR 仪进行反转录,反应条件:37°C 15min,85°C 5s。
问题1:其中试剂盒中的的③是oligodT primer Mixture(50μM) ,现在我用茎环结构的RT Primer引物,那么我的引物浓度也是跟oligodT primer Mixture一样是50μM吗?
问题2:内参U6和目的基因的RT primer是加在同一个PCR管一起逆转录吗?如果是一起,是分别加0.25μl吗?

你这是一个逆转的步骤
首先问题1,你用茎环结构的RT Primer引物代替剂盒中的的③oligodT primer Mixture(50μM),所用浓度一样。
问题2的答案,不在同一管,你每一个目的基因有独特的逆转录引物,要各自分管;U6又是单独一管,并且用随机引物(U6没有特异的逆转录引物),浓度依照protocol。

最后啰嗦一句,首先你要确认这个TAKARA试剂盒能否做microRNA的逆转。如果能,人家提供的oligodT primer是一种简便的操作方法,根本无需你自己设计茎环引物,因为每个microRNA基因需要独特设计的茎环引物,而oligodT primer则对所有microRNA基因都有效。因此,当我们做许多microRNA逆转时,都用oligodT primer。

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