用多元化生物信息云平台进行数据挖掘，博奥晶典布局精准医学全产品线最后一环
2014年人类全基因组测序成本降低至1000美元，全球基因检测领域迎来了第一个春天，中国的基因检测市场更是爆炸式增长。2017年，Illumina再次将全基因组测序成本降低到800美元。测序成本降低的同时，全世界的基因组数据也在以超摩尔比速度增加。基因数据的计算与解读一直都是基因检测的重要环节。在数据激增的情况下，如何更快速，更准确的进行数据分析和解读，将是基因检测领域下一个命题。借此契机，动脉网将推出“基因&数据”系列报道，详情可持续关注。
2012年，博奥生物子公司博奥晶典成立，作为博奥生物旗下主要的产业化平台，博奥晶典承担着集团快速产业化的使命。
以自有研发的生物芯片技术平台为主，以引进转化吸收各类国际领先的技术平台为辅，博奥晶典建立起涵盖芯片、测序、多重PCR、质谱和细胞分检为核心的新一代生物检测技术体系，并面向国内外生命科学研究、临床医学、农业以及新药研发等领域提供设备、配套试剂耗材、软件、整体解决方案等服务。据了解，如今博奥晶典的系列产品和服务已出口北美、欧洲、亚洲等30余个国家和地区。
2015年，CFDA对博奥生物研发的BioelectronSeq 4000基因测序仪颁发了医疗器械注册许可，这标志着作为博奥集团最大子公司的博奥晶典正式完成从上到下的全产业布局。
博奥晶典产业布局
晶典云：博奥晶典精准医学产品线最后一环
这一年，是王雷加入博奥生物的第5个年头。2014年开始，他便进入博奥晶典负责带领整个生物信息学团队。
博奥晶典生物信息负责人 王雷
本就是生物信息出身，再加上多年的行业实战经验，王雷意识到随着个体健康状况和疾病诊断的可预测化和个体化，组学数据和临床数据的深入挖掘也许将颠覆现代医学。
怎么样才能实现数据深度挖掘呢？全球的数据产生机构非常多，但这些数据如果不共享，自己用自己的数据，那么数据的作用就会非常有限，数据分析的可重复性还有待提升。
另一方面，随着 DNA 测序的价格越来越低，临床和组学数据的结合正面临全新的挑战。
在王雷看来，博奥晶典是一个非常有特色的公司，有精准医学的全产业链，在各个领域都有布局。他认为，开发一个傻瓜式、支持共享和协作分析的工具，帮助组学研究人员化解生物医学大数据分析的难题，是有必要而且有前景的。
近年来，生物信息云技术迅速发展，成为生物医学大数据解放方案的新生力量。尽管在传统生物信息学解决方案上有多年经验，但这一次，他们完全摒弃了传统的高性能计算集群等硬件体系。
“通过云端虚拟而低价的存储系统和计算资源，不仅能降低数据分析的时间和成本，更重要的是使得全球化的协作分析成为可能。”王雷向动脉网解释。
这样的想法也得到了公司总裁许俊泉的支持。“不仅从产业的角度分析了云平台的价值和前景，在资源和精神上也给了我们很多支持。我想这也是博奥晶典能够快速完成全产业布局，能够源源不断产生新价值的原因。”王雷告诉动脉网。
2016年11月，随着生物医学大数据分析平台“晶典云”正式发布。作为博奥晶典精准医学产品线的最后一环，晶典云完成了公司全领域的布局属性。
王雷向动脉网介绍，博奥晶典的生物信息学团队中中有一支被称为“ABC”的创新小组，即A-AI，B- Big Data，C-Cloud Computing。晶典云则是出自“ABC”之手。
功能多元化：公有云与私有云
通过保证数据分析的可重复性、可共享性和可协作性，晶典云可向用户提供一个安全、低价、高效的数据分析环境。王雷认为，这样一个符合数据开源和数据共享要求的云平台将会为临床和组学研究提供强大的基础支持，激发精准医学的潜能。
晶典云是一款多功能的产品，除了提供一个基础的PaaS云环境，方便用户在这个环境里自行开发编写分析软件，还能向用户SaaS服务。
在产品的开发过程中，团队就更注重分析结果的解读以及深层次内容的挖掘，在基础环境外还向用户提供博奥晶典所积累的自行研发的分析模块、知识库及可视化工具，帮助用户快速、方便的进行数据分析解读。
另外一个更大的特点就是产品可同时提供公有云和私有云服务。王雷告诉动脉网，对于临床机构来说，尽管目前大部分的公有云都有较高的安全性。但由于其特殊性质，这些机构对于公有云平台接受度依然不高。
基于此，晶典云提出了两套解决方案，根据不同用户需求可提供公有云和私有云服务。这就大大扩展了产品的应用范围和使用情景。
公有云上，客户可以在云上使用分析软件进行计算和分析；而私有云上，可通过将晶典云部署到本地系统，帮助客户把自己积累的算法和流程移植到晶典云上，在自己的数据中心使用。
用户多元化：科研、临床、制药领域
这样多元化的属性，也使得晶典云的用户不仅仅局限于科研机构、测序中心，还包括了临床机构和有生物信息分析需求的制药公司。
对组学研究人员而言，这样一个可自定义数据分析工作流的平台可以满足科学研究的个性化需求。资源按需扩展，按需计费又可以帮助他们合理的估计和控制科研成本。大规模数据的实时共享，能够助力全球协作，加快研究进度。进度和成本，这两点对于科研机构来说都至关重要。
对临床诊断机构来说，一个可本地部署的私有云服务可以打消他们的诸多顾虑。同时，在这个平台上可快速完成从研发到检测的转化，将检测项目与实验室管理和诊断报告集成到一个平台上，填补了试验数据到结果报告之间的Gap，大大缩短了诊断时间。
同样，云平台还可帮助生物医药企业无缝整合组学和临床数据，详细设定数据、工作流以及分析报告的访问权限，保证数据的安全性的同时又能促进部门间的协作工作，帮助研究人员快速发现药物靶点，加速药物研发。
布局多元化：打造全方位的解决方案
当然，博奥晶典在此环节的布局绝不只是云平台。早在2006年，其母公司博奥生物就在国内率先推出了分子注释系统MAS，该系统是国内最早的分子功能网络分析数据库之一。至今累计用户已经过万，成为分子生物学和遗传学工作者不可或缺的在线工具。
软件产品方面，博奥晶典开发了一款用于一代测序数据突变分析和注释的软件SVD， 不仅适用于基因检测领域，也可以应用于 CRISPR 等基因编辑工具的效果验证等领域。
王雷表示：“我们认为赋予客户真正解决问题的能力更加重要，博奥晶典不仅向客户提供全面的解决方案，更提供简单易操作的工具，帮助客户自如的完成专业的生物信息学分析。”
生物数据产生后，要经过复杂而繁琐的流程才能提取到所需要的信息。王雷告诉动脉网，2016年，生物信息分析市场规模已经达到60亿美元，预计2020年将达到160亿。
管理、存储、传输、计算、解读.....每一步的优化都充满了挑战，同时也充满了机会。这样一个多元多面云平台，这样一个整合了遗传学、分子生物学、生物信息学以及统计学和物理学的多元化跨学科团队，不知又将在未来开启一个怎样的多元化时代。
文|周梦亚
微信|rencontre_my
添加时请注明：姓名-公司-职位。
后台发送关键词即可获得相关好文！
网站、公众号等转载请联系授权
tg@vcbeat.net
中国医疗人工智能产业数据图谱：55家医疗人工智能企业完全扫描
「推荐阅读」
以年报窥全貌，130家药企的营收、净利、研发投入、战略维度分析
万达仅在成都投资高端医疗就已超850亿，王健林背后的商业逻辑是什么？
动脉网所刊载内容之知识产权为动脉网及/或相关权利人专属所有或持有。未经许可，禁止进行转载、摘编、复制及建立镜像等任何使用。