氢原子的同位素标记蛋白质

氢原子的同位素标记蛋白质

氢原子的同位素经常被用来进行标记蛋白质来进行蛋白的功能、结构和机制,然而目前将同位素标记在蛋白上主要是利用分段标记的策略,即利用同位素标记的氨基酸后在进行传统的肽段合成。这个方法往往会导致标记的某个氨基酸的标记缺乏位点的选择性,而且需要复杂的工程表达体系。目前还没有可以直接进行位点选择性在整个蛋白水平上进行氘代标记的策略。受到烯醇化合物的亲核加成反应的启发,推测可以在氨基酸和蛋白水平上生成α,β不饱和的酰胺,随后与重水(D2O)反应,从而引入氘代标记。

脱氢丙氨酸(Dha)是一种天然存在的氨基酸,它可以通过半胱氨酸(Cys)衍生生成。因此认为蛋白中的Cys转化为Dha后,Dha中的α,β不饱和的酰胺捕获重水中亲电D+,随后再与硫醇化合物发生迈克尔加成反应,可实现蛋白质位点选择性的无痕氘代标记。为了使Dha与硫醇化合物S-R反应能够得到Cys的产物,测试了R=H, Ac和PO32-等时化合物的反应活性和脱保护情况, 发现磷酸化的硫醇化合物均能成功地反应插入和脱保护。先在组蛋白H3的10号Cys位点H3-Cys10进行验证,利用双烷基化的脱除试剂DBHDA将Cys转化为Dha,随后H3-Hda10在重水环境下与Na3SPO3反应生成H3-[d1]Cys10–S–PO32-,分别可以通过磷酸酶PP1或酸环境脱除磷酸根,得到H3-[d1]Cys10, 其中酶水解1 h后的产率>95%。得到的产物在α位置存在差向异构,其中L:D的比例在1:2。也同样在H3的26号Cys位点H3-Cys26进行了同样的反应,也实现了位点选择性的氘代标记

cas号中文名称英文名称

74223-64-6UN甲磺隆-D3Metsulfuron-methyl-d3

217487-17-7异丙隆-D6Isoproturon-d6

3811-25-4UN氯丙那林-D7Clorprenaline-d7

1794810-59-5盐酸班布特罗-D9Bambuterol-d9hydrochloride

苯乙醇胺A-D3PhenylethanolamineA-d3

1276197-17-1盐酸莱克多巴胺-D6Ractopamine-d6hydrochloride

184006-60-8盐酸克伦特罗-D9Clenbuterol-d9hydrochloride

1346601-00-0羟甲基克仑特罗-D6Hydroxymethylclenbuterol-d6

1173021-09-4克伦丙罗-D7Clenproperol-d7

1325559-18-9盐酸马喷特罗-D11Mapenterolhydrochloride-d11

1219794-72-5盐酸莱克多巴胺-D3Ractopamine-d3hydrochloride

1346599-61-8克伦塞罗-D10Clencyclohexerol-d10

1353940-55-2溴布特罗-D9Brombuterol-d9

1346605-01-3盐酸喷布特罗-D9Penbutolol-d9hydrobromide

1325559-14-5盐酸妥布特罗-D9Tulobuterol-d9hydrochloride

1246819-04-4西布特罗-D9Cimbuterol-d9

1794793-20-6克仑潘特盐酸盐D5Clenpenterold5hydrochloride

497063-94-2沙美特罗-D3Salmeterol-d3

1346599-83-4可尔特罗代谢物-D93-o-methylcolterol-d9

1246819-58-8马布特罗-D9Mabuterol-d9

1353867-94-3盐酸溴布特罗-D9Brombuterol-d9hydrochloride

1173021-73-2沙丁醇胺-D9Racalbuterol-d9

97825-25-7UN莱克多巴胺盐酸盐-D5Ractopamine-d5hydrochloride

18559-94-9UN沙丁胺醇-D4Albuterol-d4

1217818-36-4齐帕特罗-D7Zilpaterol-d7

1228182-44-2西马特罗D7Cimaterol-d7

1219798-60-3沙丁胺醇-D3Salbutamol-d3

1286129-04-1盐酸非诺特罗-D6Fenoterol-d6hydrobromide

203633-19-6多巴胺盐酸盐-D4Dopamine-d4hydrochloride

129138-58-5克伦特罗-D9Clenbuterol-d9

1189658-09-0特布他林-D9Terbutaline-d9

1217226-46-4呋喃妥因-13C3Nitrofurantoin-13c3

1015855-64-7呋喃它酮-D5Furaltadone-d5

1217222-76-8呋喃唑酮-D4Furazolidone-d4

1217220-85-3呋喃西林-13C,15N2Nitrofurazone-13C,15N2

957509-31-8呋喃妥因代谢物-13C3AHD-13C3

1007476-86-9呋喃妥因代谢物衍生物-13C32-NP-AHD-13C3

1017793-94-0呋喃它酮代谢物-D5AMOZ-d5

1173097-59-0呋喃它酮代谢物衍生物-D52-NP-AMOZ-d5

1188331-23-8呋喃唑酮代谢物-D4AOZ-d4

1007478-57-0呋喃唑酮代谢物衍生物-D42-NP-AOZ-d4

1173020-16-0呋喃西林代谢物-13C,15N2SCA-HCL-13C,15N2

957509-32-9呋喃西林代谢物衍生物-13C,15N22-NP-SCA-13C,15N2

1258668-21-1孔雀石绿-D5苦味酸盐Malachitegreen-d5picrate

1173021-13-0隐色孔雀石绿-D6Leucomalachitegreen-d6

1266676-01-0结晶紫-D6Crystalviolet-d6

1173023-92-1隐色结晶紫-D6Leucocrystalviolet-d6

947601-82-3隐性孔雀石绿-D5Leucomalachitegreen-d5

1189863-86-2磺胺吡啶-D4Sulfapyridine-d4

1020719-78-1磺胺嘧啶-D4Sulfadiazine-d4

1020719-84-9磺胺甲基嘧啶-D4Sulfamerazined4

1020719-82-7磺胺二甲基嘧啶-D4Sulfamethazine-d4

1330266-05-1磺胺邻二甲氧嘧啶-D4Sulfadoxine-d4

1020719-80-5磺胺间二甲氧嘧啶-D4Sulfadimethoxine-d4

wyf 12.23
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