JingleBells：免疫相关单细胞RNA-Seq数据集
RNA测序（RNA-seq）已成为差异基因表达和mRNA差异剪接的转录组范围分析不可或缺的工具。JingleBells将单细胞数据划分为免疫和非免疫类，共收录120篇免疫相关以及182篇非免疫的单细胞文献，且数据库仍在持续更新中。这是标准化单细胞RNA-Seq数据集的存储库，用于在单细胞水平上进行分析和可视化。用户在JingleBells上可以直接下载到单细胞数据的BAM文件，有些 BAM文件比较麻烦，需科学上网方可下载。
JingleBells主页
主页蓝色的字体是代表可以跳到其他链接的地方，首页可以选择文本教程或视频教程以学习使用IGV（集成基因组学查看器）可视化下载的数据，但是有时候打不开。如果文中使用到了他们的数据库，记得要引用一下，年轻人要讲“武德”哟。同时首页数据库在尾端也附上了其他可能会使用到的数据库链接，比如scRNA-seq信息库和SCPortalen（以单细胞为中心的数据库scRNA-Seq数据集）。
Immune模块
Immune 模块和 Non-immune模块可以选择查询免疫或非免疫的单细胞RNA-Seq。两者大同小异。可以看到，网站提供了数据资料集编号、对应说明，以及论文标题和引文，生物，实验小组，细胞数，大小，BAM文件信息。
如果点击编号数字，会提跳转到该单细胞RNA测序介绍，如下：
这里介绍的是E-MTAB-4388-单细胞RNA测序（scRNA-seq），用于研究小鼠血液阶段chabaudi疟原虫感染过程中单个CD4 + T细胞的各种转录状态。这是一种疟疾的实验模型，其中CD4 + T细胞对于控制寄生虫数量至关重要，其特征是同时发展Th1和Tfh细胞。研究者已经使用了疟原虫特异性TCR转基因CD4 + T细胞来最大程度地减少TCR多样性对Th命运决定的影响。在第0、2、3、4和7天研究活化的抗原特异性细胞。此外，在0和3天研究树突状细胞和单核细胞。使用Fluidigm C1系统进行细胞裂解，RT和cDNA预扩增。最后提供了下载调查说明以及样本和数据的关系。
点击论文题目会跳转到pubmed上，点击full text即可查看对应文献。
点击Conditions（ 免疫模块)或者Experimental Groups（非免疫）的数据可以展开看具体数据。
以上即是本期关于JingleBells的内容。这个网站内容比较专一，只做免疫和非免疫的单细胞序列，如果有针对性免疫和非免疫内容需求的情况，用它用它~