随笔 | 近日二三感悟 与 荐书

最近几日，一切相对平静。没有必须做的，也没有必须不做的。多多少少，我开始整理整理手上尚未完成的，以及接下来应该做的，还有接下来想做的事情。未完成的，多少是悬在心上，尽早结束，对身体好。想做的可以以后慢慢来。而应该做的，那么是不得不处理。
一年多以前，答应过两个朋友，录制一期视频，详细讲演 TBtools GFF3/GTF 文件操作功能。当日就发起了众筹，召集了60多个人（超过50人了）。但我还是没有录制。一方面我个人时间确实有限，另一方面是我对相关功能还不够满意。
有在关注《生信札记》公众号的朋友应该清楚，前几天我终于开始启动了视频录制，而昨晚我做了一次直播。总计时长是 3个小时，实际有效时长是 2小时30分钟。说来也巧，正好小庭子喊我打羽毛球。一打就忘了时间（因为我也不懂咋打，就在学着打），计划直播是19点开始，打球打到快18点30分。匆忙便直接开了电脑，准备直播。
当然，我个人对网络讲演常常富有信心，这个与我几年的网络讲演经验有点关系。至于线下课堂，我也充满信心，毕竟前前后后组织过10来次（从二三十人到四五百人）。说来说去，这一切估计跟我本科期间参与了学生组织有点关系。尽管每每想来，当时事情处理得糟糕，但并不影响那段经历对我个人能力成长的实际帮助。
回到主题，昨晚的讲演，我想想可以给自己打个 85 分。原本计划是实践演示为主，原理讲演为辅，但最后原理部分还是拓展了不少，感觉已经接近实践演示。这个可以接受，毕竟这样会充分兼顾到零基础的朋友。今天看了评价，似乎还不错。

当然，不太清楚是不是因为用户社群在那边，大伙不敢按真实感受评价（尽管我是说了，就按真实情况来....）。
Anyway，明天（2021年04月26日），也就是周一晚上19:30，就是线下给本科生讲一门《基因组与生物信息学》的实践操作课。第一次实验课嘛，主题是《公共数据库操作和序列比对》。Emmm，任课老师休假，所以我来代上。不知后续效果如何，希望不要翻车....
最后，今天是少见的周末工作日，给大伙推荐几本书。

不时有人会问我，“你是怎么自学生物信息？”。很遗憾，我也不会生物信息。毕竟这是一个正式学科。我既非科班出身，也无相关成果。但其他人要超越我目前的状态，那么无论是生物学背景还是计算机背景出身的本科生，甚至是硕士生，还是需要有相对扎实的分子生物学方面知识。在我个人的认知范围内，似乎真的不多一入学就有足够积累。此时，我会推荐先看看《基因X》这本书。当然，最好是先进实验室，做一两年湿实验（注意，我本科到硕士做了五年多湿实验，大田育种，组织培养，分子克隆，遗传转化，我那会一直在做）。（注意，有几乎所有优惠券，这个比较难，那么就在京东买，便宜点；如果图省事，一般当当上买，便宜的多）

一直以来，不少人希望搞大规模数据分析，比如数百个样品分析。此时不上服务器几乎是不可能。那么最好是有扎实的Linux基础。经典入门书籍，自然是《鸟哥的Linux私房菜》。这本书，我个人的阅读建议是，从头到尾翻一遍，读不懂就硬读，过了就过了。回头做过一些数据分析后，再重新从头到尾翻两三遍，那么基本就都掌握了。

学习一门编程语言，总是要的。我个人是学的Perl。尽管我一直推荐python作为入门语言。但直到现在，我有时还是会想，是不是推荐perl，也其实并无问题。如果要入门，那么肯定也是经典的小骆驼。

当然，如果是python，其实常见的学习手册是可以的。