Nature子刊 | 深海沉积物中与石油代谢相关的不可培养细菌与古细菌的代谢潜力
推荐：江舜尧
编译：晚香
编辑：董小橙
加拿大卡尔加里大学董西洋博士后和Hubert教授为共同通讯作者于2019年4月18日在Nature Communications发表题目为《Metabolic potential of uncultured bacteria and archaea associated with petroleum seepage in deep-sea sediments》的文章，该文章研究了深海沉积物中不可培养微生物的多样性并预测了其对沉积物的代谢潜力。
文章摘要
至今缺乏来自深海的微生物基因组和分离物意味着人们对这个巨大栖息地的生态知之甚少。在此，我们研究了三种来自墨西哥湾东部（3000米深度）深海石油渗漏区微生物群落的能量和碳获取策略。猎枪基因组测序结果显示，每种沉积物都含有不同的化能异养型和化能无机营养型微生物群落。我们从21个不同的古细菌门和细菌门中分离出82个基因组元件，多个基因组编码脂肪族和芳香族化合物的厌氧氧化酶，包括Aerophobetes门，Aminicenantes门，TA06和深古菌门。预测分析显示，微生物之间的相互作用是由乙酸盐和氢分子驱动作用引起的，这些发现也在沉积地球化学、代谢组学和热力学模型中得以支持验证。综上，我们推测，深海沉积物正系统发生着碳氢化合物转化成热能的现象并且可能通过多样化的厌氧微生物对烃类、乙酸盐类和氢的代谢得以维持。
文中重要图片说明
图1 | 不同标记基因在E26、E29和E44位点的宏基因组数相对频率。
图2 | 构建的82个宏基因组在系统发育树中的位置。
图3 | 存在于宏基因组中的功能基因或代谢通路。
图4 | E26、E29、E44位点沉积物孔隙水代谢物热图。
图5 | 厌氧苯甲酸酯和十六烷降解的热力学曲线。
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