CRISPER-Cas9技术服务周期及流程
一种来源是细菌获得性免疫的由RNA指导Cas蛋白对靶向基因进行修饰的技术。细菌利用该系统可抵御噬菌体入侵。CRISPR/Cas系统可以识别出外源DNA,并将它们切断,沉默外源基因的表达。在自然界中,CRISPR/Cas系统拥有多种类别,其中CRISPR/Cas9系统是研究最深入,应用最成熟的一种类别。具有成本低廉,操作方便,效率高等优点。其基本作用原理为:当噬菌体病毒首次入侵宿主细菌,病毒的双链DNA被注入细胞内部。CRISPR/Cas系统会从这段外源DNA中截取一段序列作为外源DNA的“身份证”,然后将其作为新的间隔序列被整合到基因组的CRISPR序列之中。因此,这段与间隔序列对应的“身份证”被称为原间隔序列(protospacer),原间隔序列向两端延伸的几个碱基都十分保守,被称为原间隔序列临近基序(protospacer adjacent motif,PAM)。Cas9 蛋白含有两个核酸酶结构域,可以分别切割与crRNA 杂交的DNA单链(类HNH蛋白功能区)和解旋的游离单链(类RuvC蛋白功能区)。Cas9 首先与crRNA 及 tracrRNA 结合成复合物,然后通过 PAM 序列结合并侵入 DNA,形成 RNA-DNA 复合结构,进而对目的DNA 双链进行切割,使 DNA 双链断裂。
流程:1.在把基因序列中寻找NGG序列获得其附近20多个碱基的系列,与tracrRNA序列融合,设计出sgRNA(small-guide RNA)并合成该序列。2.将该序列以及cas9基因连入载体。3.转化感受态,质粒小提,测序验证。4.细胞培养与转染。5.建立稳定的敲除细胞株。
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