舶来赏析-种内与物种间比较,提高小麦Rubisco活化酶热稳定性(PP 2019)

上周小编和大家聊了欧洲小麦对气候波动性的适应性的文章(舶来赏析-现代育种体系降低了欧洲小麦对气候波动的适应性?(PNAS 2019))。全球气候变暖,极端天气越来越频繁,小麦人越来越关注这一方面,最怕倒春寒、湿热风等发生,田里的材料受影响。

今天继续这一话题,为大家解读一下最近Plant Physiology杂志刚上线的题为“A conserved sequence from heat-adapted species improves Rubisco activase thermo stability in wheat”的文章,由比利时巴斯夫农业解决方案公司(BASF Agricultural Solutions)和澳大利亚国立大学的团队完成,第一作者和通讯作者为Andrew P Scafaro博士。

植物光合作用的核心酶为Rubisco,但该酶的激活位点很容易被一些物质结合,而导致酶活被抑制。Rubisco活化酶(Rubisco activase,下简称为Rca)是一类伴侣酶,可以移除Rubisco激活位点的抑制物,从而激活Rubisco。但是Rca的活性容易受到温度、尤其是高温的影响,这也是高温下植物Rubisco酶活下降、光合作用受阻的主要原因。所以作者就想从小麦物种内和小麦与其他物种间比较的角度,尝试找到促进Rca高温稳定性的遗传线索。

在很多植物物种中,包括水稻,只有一个有功能的Rca基因,但由于可变剪切,存在两种转录本Rca-α和Rca-β。在小麦基因组中,除了也存在该同源基因(命名为TaRca2,对应TaRca2-αTaRca2-β),还存在另一个只能编码β形式蛋白的TaRca1(即TaRca1-β)。过去研究表明,TaRca2的表达量要比TaRca1的高很多。

作者首先选取了一份春小麦(cv. Fielder)和一份冬小麦(cv. Mentor),查看三个基因在热胁迫下的表达情况。无论是营养生长期的春小麦,还是开花期的冬小麦(作者没写为什么这么选择。小编推测不同小麦选择的发育期不同,是因为遭遇热胁迫的时期不同?),在热胁迫处理下,TaRca1由几乎不表达变为强烈表达(尽管不同发育时期绝对表达量不一样),而TaRca2-β的表达则受到热胁迫显著抑制。暗示TaRca1-β参与小麦的热胁迫适应。

接下来作者对三个小麦Rca蛋白和水稻中的OsRca-β(水稻是热带植物,该蛋白可作为阳性对照)进行了体外重组纯化,并测定了四个蛋白的热稳定性,发现TaRca2蛋白的热稳定性较低,其Tm值(降解一半的温度)约在35℃附近。而TaRca1-β具有更高的热稳定性,Tm值在42℃附近,与水稻OsRca-β相当。

为什么TaRca2蛋白的热稳定性较差呢?能不能改良TaRca2蛋白呢(如前所述在小麦中,TaRca2的表达量要比TaRca1的高很多)?作者先从序列比较和蛋白结构模型比较入手。比较的对象不仅选取了TaRca1-β、TaRca2-β和OsRca-β,也按照物种的生长环境,从公开数据库中挑选了一些热带植物和温带植物的Rca蛋白序列

借助上述序列,通过不同的比较策略,作者预测了可能会影响Rca蛋白热稳定性的氨基酸位点,并人工创制了三种形式的TaRca2-β改良蛋白(TaRca2-β-11AA,TaRca2-β-8AA和TaRca2-β-3AA)。进行热稳定性测定实验后发现,11个氨基酸的替换可以将TaRca2-β的热稳定性提高7℃,且不影响酶的催化活性。

文章最后,作者还从ATP添加、多聚体形成等角度,对人工突变形式的TaRca2-β进行了测定和比较。

编后语:通读下来,这篇文章简单而有趣,最关键是意义也很大。虽然缺乏体内实验证据(作者在讨论里也说了,小麦体内的遗传操作,包括基因编辑,正在进行中)。当然,同时改变11个氨基酸序列,在小麦上基因编辑或许还是有难度的。

注:少数内容参考自“莱肯生物”公众号。

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