Cas9敲除小鼠构建之体外转录步骤
1.首先,转录序列预先构建于T7启动子载体质粒,转录模板设计一般要求如下:
(1)在基因组全长克隆过程中,在正向引物的5’端添加T7启动子序列;
(2)以T7启动子作为体外转录启动子,一般启动子后面靶位序列连续带有3个G,转录效率最高;
(3)在正向引物5’端添加一个帽子G,有利于提高体外转录RNA分子的侵染活性。
2. 将含有T7启动子载体质粒进行酶切,获得线性化质粒;
(1)线性化T7质粒:
酶切体系:
10µg T7 质粒
10µl 10 X M buffer
5µl DraI酶(15U/ µl)
按照体系加入试剂,轻轻混匀,瞬时离心。然后置于37度水浴孵育3小时,孵育过程中间隔震荡一下,以便充分酶切。
(2)酶切后,取2 µl 产物于1%琼脂糖凝胶电泳,验证质粒是否线性化,可加入原始质粒作为参照,一般线性化质粒为两条带,原始质粒为三条带。不需要将线性化质粒进行胶回收。
(3)直接在酶切产物内加入4 µl RNA保护剂,60度孵育10分钟。
(4)用MinElute PCR Purification Kit纯化试剂盒按说明书回收酶切产物,最后加入10 µl Rnase-free water进行溶解。
(5)NanoDrop测回收的线性化载体浓度。
3.体外转录,选用MEGAshortscript™ Kit试剂盒。
(1)体外转录:将回收的线性化载体进行转录。
体外转录体系:
4 µl 线性化质粒模板(至少2 µg)
1 μL T7 10X Reaction Buffer
1 μL T7 ATP Solution (75 mM)
1 μL T7 CTP Solution (75 mM)
1 μL T7 GTP Solution (75 mM)
1 μL T7 UTP Solution (75 mM)
1 μL T7 Enzyme Mix
按照上述体系加入试剂(共10 µl),注意在操作过程中将全部试剂至于冰上,依次加入试剂,最后加入T7转录酶。试剂全部加入后,轻轻混匀,将EP管瞬时离心。然后置于37度水浴孵育4-6小时。
(2)转录结束后,向试剂内加入1 μL TURBO DNase ,置于37度水浴孵育 15分钟,以便移除DNA模板。
(3)转录产物选用MEGAclear™ Kit按说明书纯化回收,最后加入30 μLRNase free water进行溶解。
(4)NanoDrop测转转录后mRNA浓度。可配置1% 琼脂糖凝胶电泳180 V 10 分钟,以验证转录后mRNA条带。
(5)分装,冻存于-80度冰箱。注意mRNA易降解,存储时选择小体积冻存,按需取用,取用时置于冰上。
体外转录的操作就介绍到这里了,从上述介绍不难发现整个过程需要用到多个试剂盒,在操作过程中也一定注意无RNA酶操作。同时最好全程将试剂至于冰上,防止降解。