Omics精进03|一文彻底搞明白Germline Mutation和Somatic Mutation

胚系突变(Germline Mutation)和体细胞突变(Somatic Mutation)在WES、WGS、Gene Panel检测时常常遇到,二者最大的区别是「胚系突变可以遗传给后代,而体细胞突变不能够遗传给后代」。本文将从「形成原因、遗传性、功能、发生时期、变异检测」几个方面介绍二者的区别。

上图,直观理解二者区别

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形成原因

  • Germline mutations 主要是由于「生殖细胞(germ cells)突变」导致,生殖细胞在男性中为精源细胞,突变发生在睾丸中;生殖细胞在女性中为卵细胞,突变发生在卵巢中。
  • Somatic mutations主要是由于「体细胞(somatic cells)突变」导致,皮肤,肝脏,骨髓,眼睛等的细胞均为体细胞,但不包含生殖细胞。

遗传性

  • Germline mutations 本质上是遗传性的,因为它们发生在参与受精的配子( gametes)中。因此,已经发生突变的亲本死亡将不会消除该突变,而是「传递给后代」
  • Somatic mutations会「传给daughter cells」,一直存在直到它们最初发生的亲本细胞死亡或子细胞(如果有)死亡或生物体本身死亡为止。

上图,一个细胞分裂为两个 「daughter cells」

功能

  • 在大多数情况下,Germline mutations 是“沉默的”,不对亲本产生影响,除非它们影响配子( gametes)的产生。尽管这些突变会造成负面影响,例如「罕见疾病,甚至癌症」,但仍可促进人类健康的遗传多样性。
  • Somatic mutations仅仅在发生突变的细胞中起作用。但是,在某些情况下,它们可能会显示有害影响,如「对细胞造成损害,癌变或细胞死亡。」

发生时期

  • Germline mutations发生在「减数分裂」的过程中,因为性细胞需要将其染色体分裂成两半,以便在受精过程中恢复原始的染色体数。在精子中发生这种突变的可能性要比在卵子中发生的可能性高,因为前者形成过程中发生的细胞分裂数量要多于后者,这使得雄性的种系突变率更高。
  • Somatic mutations发生在「有丝分裂」期间,所有体细胞仅通过该过程分裂。这是因为,有丝分裂产生的子细胞具有相等数目的染色体,这对于维持细胞中的人类染色体数目至关重要。

mutation检测

  • 单有癌样本是无法区分Germline mutations和Somatic mutations的,只有加入健康样本才能过滤掉Germline mutations找出Somatic mutations。

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