【生信挖掘】临床预后模型分析

说起生信临床预后模型分析,相信大家看过很多这种类似的文献,比如

又比如
相信大家检索pubmed上发表的原创文章,很多都是构建临床预后模型,这里就不一一列举了,第一篇还是本人近期发表的。那么,今天就和大家谈谈临床预后模型如何构建。
大家学习生信,第一点,一定要记住把生信当作一门工具就像PCR,wb一样,我们只需要会用就可以
临床预后模型的构建,主要分为三大类:单因素+多因素;单因素+Lasso;单因素+Lasso+多因素。
接下来我们就分别简要谈谈。
单因素回归分析,通过这个操作,我们可以得到与预后相关的一些因子,然后这些因素之间可能有相互关联;而lasso和多因素分析就是去除这些关联性,那么三种预后模型构建方法有啥特点呢?
1.单因素+多因素,这个是小编以前经常用的方法,也是目前文献主流使用方法之一,可以看下图,通过这种分析我们可以得到一个预后模型,同时我们可以进一步对其进行可视化,也就是做点森林图,这样就可以完成你的一个模型构建,后续就是对你的模型补充说明。总体来说,这种选择,中等,模型较严谨,出的图也多。
2.单因素+Lasso,这个方法本人从未使用过,只是看文献和朋友交流,他们以前做影像组学经常使用。这种方法本人未使用过,我的理解是和上面相比,在去除因素之间的相互影响统计学方法侧重点不一样。总体来说,这种选择,中等,模型较严谨,出的图也较多。
3.单因素+Lasso+多因素,这种方法小编在近期新写的文章里面使用了。这个模型构建方法其实是最严谨了,相当于把前面两个结合了,出的图也最多,那么有人就问,我一直使用这方法可不可以?肯定可以啊,但是前提你可以构建的出来,因为经过这么严格的条件,可能你模型预后因素出不来了。总体来说,这个选择最严谨,出来的数据最多,图也多,但是可能由于条件过于严格得不到结果。
那么今天的讲解到这里了,主要给大家介绍一下生信领域发文最常用的临床预后模型构建,实际使用就和SPSS使用一样,傻瓜式操作,我们分享代码,大家复制粘贴一下,数据改成自己的,就可以操作。
我们不生产代码,只做代码的搬运工。
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