基因工程小鼠命名方法

对从事医学生物研究的工作人员而言，基因工程小鼠已经成为绕不过去的通往取经路上的大山，因为现在基本上较高水平的研究都会用到这个通用工具，那么关于它的命名，您都明白是怎么回事吗？如果还有不明白的地方，我们一起学习一下吧。

常见的基因工程小鼠可以分为两种命名方式：

1. 基因定点修饰的小鼠命名，比如：敲除、敲入、点突变等等。

2. 随机转基因的小鼠命名。

我们首先介绍基因定点修饰的小鼠命名

这一类小鼠的命名基本长这样：

（1）品系背景

如果是在单一的小鼠背景上完成的基因修饰，并且在繁育过程中未引入其它品系，那么就可以以品系简写来表示。比如：C57BL/6简写为B6。如果是在混合品系背景上，那么可以用这几个品系（<3个）缩写，并以分号作为间隔。分号前表示受体，分号后表示供体。比如：在一个来自C57BL/ 6与129杂交 ES细胞系上定点敲除某个基因，就可以用B6;129表示。直至这个品系与 C57BL/ 6 小鼠回交至近交系程度，那么可以改写为B6.129。

如果供体品系是混合背景或有未知来源，那么回交至受体品系的近交系程度后，可以用.Cg来表示，比如：B6.Cg。

如果存在3个以上祖系或有未知来源的混合遗传背景，那么以STOCK来表示。

被修饰的基因

这里的基因名用的是GeneSymbol。GeneSymbol和GeneName到底有什么区别呢？

GeneSymbol有以下特点：物种中唯一的；短，3-5个字母，最多不超过10个字母只用罗马字母和阿拉伯数字；大写字母开头，后跟小写字母或数字；不包括组织特异性或分子量；最好跟GeneName的首字母一致；斜体表示；不同物种的同源基因使用相同的GeneSymbol。GeneName则一般有以下特点：简短，可以是几个单词，包含基因功能或特点；首字母小写（人名或专有名词除外）；使用美式拼写方法。

举个例子你就明白啦，例如：Shh 是GeneSymbol，而sonichedgehog则是它的GeneName。所以，如果你想查找某个基因的敲除品系，那么最好输入GeneSymbol，而不是GeneName或者曾用名。

值得注意的是定点过表达的这类情况：

目前最常用的两个定点过表达的整合位点，一个 Rosa26位点，一个是 H11位点。

Rosa26是一个基因，所以可以用它的GeneSymbol，也就是 Gt(ROSA)26Sor。H11并不是某一个特定基因，而是存在于两个基因之间的一个特定染色体位置，所以没有GeneSymbol。目前公认的命名是 Igs2，表示intergenicsite 2 的缩写。

（2）修饰方式

tm：对于 ES细胞打靶途径获得品系，用 tm表示 targetedmutation。

em：对于CRISPR/Cas9 或TALEN等核酸酶系统介导的基因修饰品系，

用em表示endonuclease-mediatedmutation。

（3）编号

这里的编号是指在该实验室中，对该基因修饰的序列号。

例如：Trp53tm1Holl表示在Holl实验室对Trp53基因进行的第一次突变。

有时候会看到tm1.1、tm1.2的情况，这是指条件性基因敲除（CKO）小鼠在与生殖系重组酶工具鼠交配后获得的子代小鼠品系，为了与亲代CKO小鼠（编号为tm1）区分。而亲代CKO小鼠与其它组织特异性重组酶工具鼠交配的子代就不单独命名了。

（4）插入结构

对于基因敲除和条件性基因敲除，在命名中一般不加入插入结构的部分，即编号后紧跟实验室代号。

例如：Trp53tm1Holl。如果有敲入的基因，可以在括号内写出插入的外源基因。

例如：Cd19tm1(cre)Labcode表示在 Cd19基因中敲入Cre基因。

如果敲入的是 RNAi，那么把RNAi针对的靶点写进括号中。

例如：Genetm#（RNAi:Il23a）Labcode 。

（5）实验室代号

一般实验室代号是机构名称的首字母缩写。

比如：J表示 The Jackson Laboratory；Kyo代表 Kyoto University；等等。