Seurat包基本分析实战—文献图表复现 / 开普饭

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

简介Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析.Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型的单细胞数据的函数.目前Seur ...

摘自:xuzhougeng https://www.jianshu.com/p/cf7a7341b0b6 目前该软件只支持Mouse和Human,不支持其他物种,因此不是这两个物种的小伙伴可以不用看了 ...

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

有了生物信息学数据分析,生命科学领域研究从此大不一样,不再是玄学.而且很多高质量的CNS文章,还好把配套文章的图表的数据和代码全部开源.比如前些天我们公布了唐医生推荐的<这个20G的单细胞项目数 ...

序第三单元第十讲:使用Seurat包载入数据,创建对象 1rm(list = ls()) 2Sys.setenv(R_MAX_NUM_DLLS=999) 3## 首先载入文章的数据 4load( ...

上个月我们组建了:<单细胞CNS图表复现交流群>,见:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞),也分享了单细胞转录组数据分析的流程: 祖传的单个10x样本的seurat标 ...

前言前面我们的教程讲到了,自己取全部的上皮细胞,以及部分Fibroblasts和Endothelial_cells细胞来一起运行inferCNV流程,但是得到的结果很诡异,明明是作为二倍体正常细胞参 ...

脑淀粉样血管病(cerebral amyloid angiopathy,CAA)是一种与年龄相关的常见脑小血管病,多呈散发型,是老年人自发性脑叶出血和认知功能障碍的常见原因.短暂性局灶性神经系统发作( ...

易点评胆囊癌(GBC)是一种高度侵袭性的胆道恶性肿瘤,对GBC的研究长期以来一直有限,为了弥补GBC研究上的不足,本文专门针对胆囊癌发生发展过程的表观遗传学变化进行了研究.作者建立了胆结石→异常增生 ...

日线标准:20日均线和60日均线,5日均线和20日均线有比较大的夹角:60分钟的最低点离120周期均线距离超过10%,macd形成背离或者背驰.品种选择:创精选88:通信etf

#上影线反包##技术分析##股票#上影线很重要,也不可怕.很多人认为上影线是上涨受阻的信号,其实上影线也是洗盘的信号.主力要想继续拉升,有可能会用上影线来测试上面的抛压,一旦拉起来有资金抛售筹码,拉升 ...

导读:今天文章的主题是如何深度分析一家企业或者叫战略分析,这并不是局限在一般数据分析层面的东西,职级从底层人员到中高层管理,我想都需要对自己的企业有个比较宏观且全面的了解. 这并不是说今天销售额环比增 ...

Seurat包基本分析实战—文献图表复现