β-actin居然可以两条带?!(片尾有彩蛋哦^_^)

身为内参界的大腕,β-actin凭借稳定单带的优点集万千宠爱于一身!

然鹅,万万没想到,β-actin也有“掉链子”的时候!那出现两条带的beta-actin究竟对不对呢?

我们先来看下面这两个 β-actin的检测:

(图片来源于网络)

第一个图中一条带的 β-actin 的正确性是毋庸置疑的,但是第二个图中actin俨然不止一条带。我们先来看看这个问题是否普遍存在:

作为内参的 β-actin多条带问题这么普遍,那究竟是什么原因呢?

原来科学家们发现,有很多酶都可以降解actin(由于不同actin亚型序列差别不大,所以下面统称actin。这一系列酶的种类多得超乎你想象!

除了这些酶的作用,在有些特殊的刺激下,比如凋亡,actin也会降解!

咱们熟悉的42 kDa的actin,发生降解后会产生35-38 kDa、~30 kDa, 15 kDa等典型片段来,其中35-38 kDa的片段最为常见,这是因为不少酶都会在Val43和Met44这两个氨基酸中间切开它,也就是下面这个意思:

综上所述,如果actin出现多条带,建议从以下几个方面考虑解决:

1. 像上面提及的凝血酶、组织蛋白酶等在各组织里和细胞里的分布比较广泛,在裂解过程中它们极有可能是降解actin的主要因素,因此需要设法抑制蛋白酶活性,比如引入蛋白酶抑制剂、避开蛋白酶最适活性温度等;

2. 对于贴壁细胞,在传代过程中使用的胰酶也是一个潜在威胁,在传代的时候需要控制好消化时间,防止消化过度,尤其是在最后一次传代时,细胞密度尽量传低,以充份稀释残留的胰酶,同时提高未被降解的细胞的比例。

3. 保持细胞处于良好的状态,防止发生凋亡。对于研究凋亡的童鞋来说,可以考虑用其它内参。

4. 防止细胞被微生物污染、防止裂解产物被微生物污染,提蛋白的全部器皿尽可能干净无微生物污染。(关于提取蛋白的更多细节建议参考我们关于蛋白抽样的推文

但是,针对富含大量蛋白酶的组织(如消化系统组织)和细胞(如U-937, Raw264.7等细胞),即使用了上述方法,依然有较大可能出现actin被降解的可能。那怎么办?

不用担心,Proteintech已经完美解决这一问题!

我们来看看Proteintech的两支 β-actin单抗:

Proteintech的60008-1-Ig可以识别出一条降解片段来,但是66009-1-Ig只能测出全长来,原因就是66009-1-Ig识别的位点位于前43aa内。

所以,当实在无法解决beta-actin出现降解条带但又需要漂亮图图的,如果确认目的蛋白不受降解影响或影响极小的,可以考虑采用Proteintech 的66009-1-Ig来解决。

另外需要注意的是,N端的序列在物种间的保守程度不如C端,因此Proteintech 的 β-actin抗体60008-1-Ig可以识别更广泛的物种,最低可以识别酵母actin, 而66009-1-Ig只能识别线虫或更高等的动物。

为了方便大家选择产品,我们顺便把这两个产品的对比列出来:

(注意:60008-1-Ig亚型为IgM,不适合做IP实验。)

怎么样,WB要重做的理由又被K.O了一个,有木有很开心?


~ 彩蛋来袭 ~

本期

留言被点赞数前五名的评论作者

会获得星巴克50元的电子星礼卡一张

留言点赞截止时间:2017年6月15日

点赞数排名前五的评论作者名单将于下期推文中公布

(0)

相关推荐

  • 黄俊祺团队综述肌动蛋白机器在不同细胞程序性死亡中的机制

    根据细胞死亡命名委员会关于细胞死亡的分类,细胞死亡可以分为意外性细胞死亡(Accidental Cell Death, ACD)与细胞程序性死亡(Programmed Cell Death, PCD) ...

  • 含塞姆利基森林病毒复制子hiv多表位核酸疫苗构建和表达.pdf

    球AIDS流行的病原,根扼env和gag基因的序列,可以将HIV一1分为M亚型.0亚型和N亚型.各亚型病毒基因的序列差异超过45%,同一亚型之内有3%一23%的差别.O亚型内各毒株也有高度的异质性.H ...

  • WB结果不理想,你内参选对了吗?

    感谢您的关注! 内参对照意义 蛋白作为生命活动的承担者,一直以来都是咱们科研人的主要研究对象之一.而在众多蛋白研究方法中,Western Blot又是最常用的一种.但是对于WB实验,如果你想得要一个有 ...

  • 工欲善其事必先利其器--蛋白/RNA内参的选取

    不知道从什么时候起,一提到内参,首先想到的就是GAPDH,或者β-Actin,如果还能说出Tubulin,那真是好不得意. BuT,关于内参的选择,是否就这么简单呢?里面的一些弯弯绕绕,让美丽带大家来 ...

  • GAPDH,Tubulin,Actin选哪个做WB内参更好?

    GAPDH,Tubulin,Actin是WB实验中最常用的三种上样内参(loading control),因被认为表达水平受环境因素影响较小,在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达或变化很 ...

  • 常用的标签抗体丨myc、HA、Flag、His、GST等

    三大内参: beta Actin,肌动蛋白,细胞骨架蛋白.它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物.beta Actin 作为内参是得到公认的,针对大多数组织和细 ...

  • WB又出现杂带,你考虑过这个环节吗?

    做WB的小伙伴们都知道,样品制备是非常重要的一个环节. 有效的样品制备不仅能让咱们事半功倍,节省实验时间:同时它还会影响WB实验结果的准确性,以及实验的可重复性. 那么究竟什么样的蛋白样品才是成功有效 ...

  • 泛素和泛素化介绍

    泛素 泛素为含76个氨基酸.大小约为8.6 kDa的小蛋白质,在真核生物中普遍存在且高度保守.人类基因组中的四个基因编码泛素:UBB,UBC,UBA52和RPS27A. 泛素氨基酸序列: MQIFVK ...