Cell子刊 | 糖尿病创面微生物组的菌株和物种水平变异与临床结果和治疗效果相关
推荐：江舜尧
编译：董小橙
编辑：董小橙
美国宾夕法尼亚大学Elizabeth A. Grice于2019年4月18日在《Cell Host & Microbe》上发表题目为《Strain- and Species-Level Variation in the Microbiome of Diabetic Wounds Is Associated with Clinical Outcomes and Therapeutic Efficacy》的文章。该文章研究了微生物群落在慢性糖尿病伤口患者的伤口愈合，临床结果和治疗反应中的作用。结果表明金黄色葡萄球菌的菌株与不良结果相关，清创治疗耗尽了伤口中的厌氧细菌并且具有有利的结果。
文章摘要
慢性伤口是糖尿病的主要并发症。为了研究定植的微生物群落在糖尿病伤口愈合，临床结果和干预措施反应中的作用，我们对神经病理性糖尿病足溃疡（DFU）患者进行了一项纵向前瞻性研究。
宏基因组鸟枪测序显示，金黄色葡萄球菌的菌株水平变异和生物膜形成的遗传特征与不良结果相关。培养伤口处的金黄色葡萄球菌分离菌株在小鼠模型中引起与患者结果相对应的差异表型，而其他分离菌株如Corynebacterium striatum和Alcaligenes faecalis（通常被认为是共生物或污染物）也显著影响伤口严重性和愈合。抗生素抗性基因广泛存在，并且清创但不是抗生素处理显著改变了有良好治疗效果结果的患者伤口中的微生物群落（DFU微生物群落）。
这些发现表明，DFU微生物群可能是临床结果和治疗干预反应的标志物。
文章重点
纵向分析糖尿病足溃疡患者伤口处微生物群落
金黄色葡萄球菌菌株与不良治疗效果相关
金黄色葡萄球菌和伤口处其他分离菌株促进了不同的伤口愈合反应
清创减少了伤口中的厌氧细菌，结果良好
文中主要图片说明
图1. 糖尿病足溃疡微生物组的鸟枪法宏基因组测序
图2. DFU微生物群的菌株水平的相对丰度
图3. 金黄色葡萄球菌菌株异质性与临床结果相关
图4. 金黄色葡萄球菌DFU分离株的比较基因组分析
图5. Metagenome注释显示与临床因素和结果相关的功能子系统
图6. 主要伤口分离物导致差异宿主反应和伤口愈合
图7. DFU微生物组对干预的反应预测治疗时间
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