5天单细胞转录组培训仅需300欧元而且是包食宿哦

举办方建议参与者需要提前学一学基础知识

EMBL-EBI给的资料是：
  • Basic introduction to the Unix environment:
www.ee.surrey.ac.uk/Teaching/Unix
  • Introduction and exercises for Linux:
https://training.linuxfoundation.org/free-linux-training

  • Basic R concept tutorials: 
www.r-tutor.com/r-introduction
但是我推荐的当然是我们生信技能树的系统性基础入门啦！
首先是LINUX学习
我在《生信分析人员如何系统入门Linux(2019更新版)》把Linux的学习过程分成6个阶段 ，提到过每个阶段都需要至少一天以上的学习：
  • 第1阶段：把linux系统玩得跟Windows或者MacOS那样的桌面操作系统一样顺畅，主要目的就是去可视化，熟悉黑白命令行界面，可以仅仅以键盘交互模式完成常规文件夹及文件管理工作。
  • 第2阶段：做到文本文件的表格化处理，类似于以键盘交互模式完成Excel表格的排序、计数、筛选、去冗余，查找，切割，替换，合并，补齐，熟练掌握awk,sed,grep这文本处理的三驾马车。
  • 第3阶段：元字符，通配符及shell中的各种扩展，从此linux操作不在神秘！
  • 第4阶段：高级目录管理：软硬链接，绝对路径和相对路径，环境变量
  • 第5阶段：任务提交及批处理，脚本编写解放你的双手
  • 第6阶段：软件安装及conda管理，让linux系统实用性放飞自我
然后是R学习
我在在生信分析人员如何系统入门R(2019更新版) 里面给初学者的知识点路线图如下：
  • 了解常量和变量概念
  • 加减乘除等运算（计算器）
  • 多种数据类型（数值，字符，逻辑，因子）
  • 多种数据结构（向量，矩阵，数组，数据框，列表）
  • 文件读取和写出
  • 简单统计可视化
  • 无限量函数学习
5天培训内容
妥妥的干货：
  • Single cell RNA-seq experimental design
  • scRNA-seq analysis pipelines for smart-seq and droplet-based data
  • EMBL-EBI Single Cell Expression Atlas Service
  • Human Cell Atlas data & Metadata standards
  • General principles of data management, data FAIRification and best practice for generating and working with single cell RNA sequencing and image-based transcriptomics data
详细课程表见：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/single-cell-rna-seq-analysis-using-r
第一天
第二天
剩下的安排，自己看：https://www.ebi.ac.uk/training/events/2020/single-cell-rna-seq-analysis-using-r
单细胞培训何必舍近求远
生信技能树联合单细胞天地也推出了：7个小时的单细胞转录组视频课程（限时免费）  足足7个小时，34集，涵盖了单细胞转录组背景知识以及数据处理的知识体系，希望能够帮助到你的课题哦！
包括上游流程，包括：
而且不管你的课题是多少个单细胞样本， 都有发表的机会，见：
在教程：使用seurat3的merge功能整合8个10X单细胞转录组样本  和 seurat3的merge功能和cellranger的aggr整合多个10X单细胞转录组对比 我也给出了后续R代码读取10x单细胞转录组数据的3个文件的表达矩阵。
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