FEMS Microbiology Ecology | 中科院城环所朱永官团队:长期施肥对线虫肠道菌群的影响

推荐:江舜尧

编译:阿昊

编辑:小菌菌

中国科学院城市环境研究所朱永官院士课题组2020年3月13日在FEMS Microbiology Ecology发表题目为《The driving factors of nematode gut microbiota under long-term fertilization 》的文章,进一步揭示了长期施肥对土壤生态的影响。

文章摘要

研究背景:动物的身体内存在大量定植微生物,这些微生物可以为宿主提供必不可少的服务。虽然线虫肠道菌群近年来得到了广泛的研究,但长期施肥对土壤线虫肠道菌群的驱动因素尚不清楚。
方法:采用16Sr RNA技术,研究了不同施肥方式(对照、无机肥和混肥)和不同施肥时间(5y、8y、10y)对线虫肠道菌群结构的影响。
结果:结果表明,线虫肠道菌群以AF502208(厌氧菌)、Enterobacter(肠杆菌属、植物凋落物分解菌)和Ancylobacter(屈曲杆菌属、有机质分解菌和氮循环菌)为主要的核心菌群,与土壤菌群有明显区别,其构成是一个非随机过程,这证明了个体条件是肠道菌群差异的影响因素之一。此外,施肥方式对线虫肠道菌群的影响大于施肥时间。无机肥显著降低了Shannon指数所示线虫肠道菌群的多样性(P<0.05)。典型对应分析(Canonical correspondence analysis)表明,土壤pH、有机质、总磷、速效磷、铵态氮、水分、硝态氮、全氮等性状对线虫微生物群落有显著影响。结构方程模型(Structured equation models)进一步揭示了施肥对线虫肠道菌群的影响是明显的,即使同时考虑了土壤细菌和土壤性质的驱动因素,施肥对线虫肠道菌群的影响仍然存在。
结论:长期施肥条件下线虫肠道菌群的变化是环境因素和寄主条件共同作用的结果,这对进一步认识农业生态系统中寄主菌群的变化有一定的帮助。

文中重要图片说明

图1 | 线虫肠道菌群的构成、α、β多样性分析。

图2 | 线虫肠道核心菌群的OTU频率分布。

图3 | 线虫肠道和土壤微生物群落的比较。

图4 | 不同施肥方式对线虫肠道菌群的影响。

图5 | 网络分析。

图6 | 结构方程模型(SEMs)显示了施肥方式、施肥时间、细菌丰度、细菌多样性和土壤性质对线虫肠道菌群的直接和间接影响。




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