拷贝数变异（CNV） / 开普饭

基因印记(Genomic imprinting)是一种重要的表观调控机制.通常情况下,人类这种二倍体基因组的两份等位基因都可以表达,但少数(小于1%)基因由于受到基因印记影响,其中一份基因失去作用.例 ...

甲基化特异MLPA技术(Methylation-Specific MLPA, MS-MLPA)是MLPA技术的一种衍生技术,可用于同时对多个目标的甲基化进行半定量分析. 与常规MLPA探针一样,MS- ...

概述 Angelman 氏症候群(天使综合征)(Angelman syndrome,AS)是一种由于母源 15q11-13 染色体区域的 UBE3A 基因表达异常或功能缺陷引发的神经发育障碍性疾病.主 ...

单亲二体(Uniparental disomy, UPD)是指个体的同源染色体或其上的一部分均来自双亲中一方的一种染色体缺陷,能够造成基因印记障碍或基因纯合突变,从而导致各类疾病的发生,后者称为片 ...

Angelman综合征为一种染色体疾病,经染色体高分辨分析常发现为15q11-q13缺失,随后研究表明为来源于母系的缺失(而Prader-Willi综合征为来源于父系的缺失).这些研究结果表明15q1 ...

拷贝数变异 (Copy Number Variation, CNV) 是由基因组发生重排而导致的,一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少[1].拷贝数变异是人类许多疾病(如肿瘤.遗传 ...

PDF R Script 读其文档的时候发现,是可以针对单个样本进行拷贝数变异分析的,代码如下: library(seqCNA) data(seqsumm_HCC1143) head(seqsumm_ ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了一半broad开发的inferCNV软件,但是只运行了其测试数据,远远不够.单细胞转录组数据分析CNV使用broad出品的i ...

前面我们介绍了单细胞转录组表达矩阵可以推断CNV的文献出处及历史,也简单过了broad开发的inferCNV软件,在其提供的测试数据上面成功运行了,也测试了airway这个转录组数据,但是效果不好,现 ...

主要是上游流程,读文章拿到数据后走标准的比对流程,计算覆盖度测序深度,文章是(2020年4月份)第16周(总第112周 )- 单细胞基因组测序表明TNBC的CNV发展是爆发式的 http://www ...

inferCNV用与探索肿瘤单细胞RNA-seq数据,分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy number alterations, CNA), 例如整条染色体或大片段染色体的增加或丢失( ...

作为国内遗传病基因诊断领域的领先者,凯昂医学通过其自主研发的聚合检测技术为5000多例患者提供了诊断服务,其中不乏让公司团队印象深刻的案例: 一名7月龄患儿因"癫痫反复发作"就诊, ...

拷贝数变异（CNV）