m7G与疾病相关性分析数据库
说起RNA甲基化,在调控基因表达、编辑、稳定性及降解等方面扮演重要角色,相比于 DNA 甲基化,RNA甲基化显得更加复杂,普遍存在于各种生物中。主要包括m1A、m5C、m6A及m7G等。其中m6A甲基化,想必大家都不会陌生,毕竟作为现阶段研究的热点,其作用不容小觑。但对于m7G,想必不太了解。
7-甲基鸟嘌呤(m7G)修饰在调节各种生物过程中起着重要作用,广泛分布于tRNA、rRNA、以及真核生物mRNA的5’帽子区,对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用,并与多种疾病相关。作为一个新兴热点,又如此重要,怎么能放过它呢?今天小编就给大家介绍一个探究与疾病相关的m7G位点的数据库:m7GDisAI(http://180.208.58.66/m7GDisAI/index.html),基于异构网络的模型,推断潜在的与疾病相关的m7G位点。
根据链接地址,打开Home页面后,可以发现页面非常简洁,只需要输入疾病名称,点击搜索即可完成。
我们可以输入任何字母以相应地触发下拉框,然后选择所需的特定疾病名称。例如:这里输入“cancer”,会相应出现多种癌。这里我们点击“Prostate cancer”后,点击Go,将查询与前列腺癌相关的m7G位点。
下图显示了前列腺癌的查询结果。对于该表格表头含义,下方均已给出了详细解释,这里就不过多阐述了。
注意:如果与特定疾病相关的m7G位点数超过20,则仅显示关联得分最高的前20个m7G位点,此处显示1条信息,说明仅有1条信息与之相关。
点击该m7G位点的超链接,可跳至该位点的详细信息页面。
该网站的Table页面,显示了所有741个m7G位点。单击m7G_Site_ID,将在新的表格中显示更多的详细信息。而Disease_Number是可能与此位点相关的疾病总数,单击该数字,则可以看到疾病名称和相关信息。
这里我们单击上述表格中的Disease_Number(绿色方框),则可以显示所有预测的相关疾病名称、DOID、基因名称和评分情况。
该网站的Introduction页面,则是对该网站使用方法的详细介绍,具体是没有什么难处的。今天之所以给大家介绍这个网站,主要是因为m7G这个甲基化比较新颖,当我们研究一种疾病不知道从何处下手时,不妨蹭一蹭这个热点嘛~