微生信生物-扩增子V0.1.exe发布

写字前面：  ◆  ◆

不知不不觉已经是2020年了，今天我们进行了真人CS游戏，提着老腿确实很累。几场下来我就累得不行了，所以微生信生物-扩增子V0.1.exe发布稍微晚了一些，但是是赶在今天结束之前发出来，算是2020年打响的第一炮。这份工作是赵向阳连夜赶工的成果，我本人只是修好了script而已，大家多多支持。

微生信生物-扩增子V0.1.exe 简介：

这套程序我封装了扩增子下游基本分析的八个部分脚本，主要包含以下内容：

1 alpha多样性：我提供了七种指标的计算和出图，虽然指标有点少，但是你只需要上传otu表格就好了，抽平和出图，还有差异检测都会帮你一键完成。

2. Beta 多样性，这里选择bray距离进行Pcoa排序，之后使用adonis进行不同群落差异分析，并将结果整合到图形中。

3. 群落组成分析，包装了我们之前推送了：一条代码完成堆叠柱状图-冲击图的操作-终结版的全部内容（https://mp.weixin.qq.com/s/NquLCDT_P_CoE5c1nDT2FQ）。

4. 韦恩图：分析群落OTU总体统计情况，提供韦恩图和upset两种出图方式；

5. 差异分析：这里有最全面的差异分析方案供你选择，提供DEsep2，Edger，ttest，wlx非参数检验四种方法进行选择，并且均可以进行两两组比较，囊括你全部的差异分析需求。

6. Networkplot：提供网络分析及其出图方式，并且自动计算网络全局属性并输出，不同处理会按照处理进行网络分析，全部囊括，得到全部网络的分析结果。

7. 类韦恩图-花瓣图在处理数量超过6组之后变得很有用，直接关注共有和特有部分的OTU。

8. RDA-CCA：环境因子和群落相关分析我们选择了RDA和CCA方法，使用DCA进行判断，然后选择合适的模型进行分析出图。如果两种模型都适合，则都分析出图。

9. Crawler：爬虫，目前只可以对nature进行爬虫，得到对应关键词的文章列表。

软件界面：

这