如何快速得到（一堆）植物的进化关系？
从进化的尺度，看一些指标
示例一
示例二
写在前面
"Nothing in Biology Makes Sense Except in the Light of Evolution"，相信是几乎所有做生物学问题的人所知道的。这句话强调从进化角度看到生物学问题的重要性。而事实上，从进化的角度看待生物学问题，可能并不仅仅是重要，而且是有效。个中意义不做详细解释。
那额在做植物上的生物学问题时，从进化角度看待当前生物学问题，我们则需要一棵公认的进化树。基于这棵树，我们才能知道某个指标，在进化尺度上的变化。
进化树重构是一门学问，我个人的认知范围内，目前并没有绝对可靠的进化树。但是在植物，或者说，被子植物上，存在APG这一个系统，维持了科水平的进化关系。
于是，当我们得到自己感兴趣的一系列物种某个指标观察值之后，我们需要一棵树。那么这棵树，并不需要我们自己去重构，去推断（毕竟这是进化方向的研究工作者才擅长的）。我们可以基于APG，直接从这一系列物种的拉丁学名，提取出自己所需要的进化树。
很久以前，我已经提出过这么一个工具的想法。也很遗憾，居然真的没有人去写。仔细想来，大概有三个原因：
1.想法太low，会的人不愿意写
2.善于使用工具的人太多，熟练掌握R包，网页等工具，可以拿到想要的东西，即使很慢
确实用不到这个工具
好吧，既然还是没人写，我又需要用到。于是，我就还是写了。
使用工具
首先，我们需要找到工具，并打开工具对应的界面
随后，我们需要设置数据库文件
这个数据库文件，在第一次使用时，可以通过点击PrePare DB
点击之后，需要等待几分钟（取决于网速），一直到完成窗口弹出。（当然，你可以直接找其他人准备好的数据库）
接下来，需要做的就是输入一堆双名
随后，点击即可
以上，看起来可能似乎复杂，那么现在，只输入几个常见的拉丁学名
Amborella_trichopoda
Arabidopsis_thaliana
Citrus_sinensis
Glycine_max
Musa_acuminata
Oryza_sativa
Solanum_lycopersicum
Vitis_vinifera
写在后面
很多时候，我也想用现成的工具。但事实上，常常并没有无法得到满足。或者是没有现成工具，更或者已有工具真的不顺手。于是，还是写一个，起码自己用得开心。
顺便
好像还是有很多做生信的朋友，那么就再开一个微信群？
如果你加不了，那么就加我好友，发个红包，说明加群（当然，群有群的规定，发了红包一样会被清理，请慎重）