郭一然博士关于健康人做全外显子测序的意义讨论指导
病例来源:
2017-10-22
遗传诊断大师群(一)
田医生问:
请教各位老师,如果检测健康人的全外显子预测与某种疾病的相关性(也就是发病的概率),大家都是用的哪个数据库或什么算法?
郭一然 费城儿童医院怡:
hgmd。
田医生:
@郭一然-费城儿童医院,好的,谢谢郭老师。我先学习一下,有什么不懂的地方再向您请教。郭老师,为了使结果准确,是否还需要多加入一些其它数据库一起来看呢?
郭一然 费城儿童医院怡:
没错。
田医生:
那一般还会选择哪些权威数据库呢?
郭一然 费城儿童医院怡:
不好意思我刚才没仔细看,你是说健康人?
田医生:
是的,或者说临床上还没有表现的人群。
郭一然 费城儿童医院怡:
健康人做全外(WES)的目的是什么呢?如果是预测与某种疾病的相关性,那就要明确是哪些疾病,因为遗传在不同疾病中的贡献不同,结果的可信程度也就不同。而且相关性不是致病性(association is not causation)。如果你用的是WES,那么很可能就会漏掉introns,utr,regulatory regions等等地方的variants,这对于一些常见复杂疾病(2型糖尿病、心血管类疾病、高血压等等)的风险预测是很大的限制。
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