IFMS | RT-PCR对FIP诊断有何意义？S基因是什么？

导语：上一篇文章中的诊疗路径提到了一种检测手段叫作RT-PCR。它主要分成两种，第一种是检测猫冠状病毒（general），第二种是检测冠状病毒的S基因突变。为什么我们特别要去关注冠状病毒的S基因突变呢？S基因其实就可以理解为病毒入侵机体细胞的钥匙，“巧夺天工”的S基因突变可能会增加钥匙的匹配度，从而使得病毒入侵细胞从而大量繁殖，也就是我们常说的病毒毒力增加。所以无论是人还是动物的冠状病毒，S基因都是非常重要的研究靶点，是体外诊断和创新药物的研发的突破口。所以RT-PCR在FIP诊疗流程中承担了重要的一环。那么经确诊的FIP患猫的组织样本在RT-PCR中的表现如何呢？对于兽医临床工作的采样选择有哪些提示？我们拭目以待。

实时RT-PCR检测：FIP患猫体内是否存在含S基因突变的猫冠状病毒

目的：当猫冠状病毒(FCoVs)在宿主内突变为高毒力生物型且免疫应答无法控制感染时，就会出现猫感染性腹膜炎(FIP)。FCoV刺突(S)基因突变被认为通过使FCoV感染和在巨噬细胞中复制而导致毒力的改变。本研究采用两种不同的实时RT-PCR对临床条件下获得的不同样本，研究了FIP猫中是否存在S基因突变的FCoV。

带有碱基编号的FCoV基因组

方法：通过细针穿刺(FNA)和切口活检(IB)采集了腘和肠系膜淋巴结、肝、脾、网膜和肾各20例、EDTA血液13例、血沉棕黄层涂片13例、血清11例、积液14例、脑脊液16例样本，此外还采集了20例房水和6例腹腔灌洗液样本，以上样本均取自20只经免疫组化诊断为FIP的猫。样本采用针对FCoV 7b基因的RT-PCR检测，检测所有FCoV，S基因突变RT-PCR（靶向核苷酸23531和23537的突变）。计算各样本类型中检出的FCoV流行率。

结果：在20/20只猫中，至少一个样本中存在S基因突变的FCoV，但存在样本阳性的变异。S基因突变的FCoV最常见于积液（64%，95%置信区间[CI]39-89），其次是脾脏、网膜和肾脏IB(50%，95%CI28-72)、肠系膜淋巴结IB和FNA(45%，95%CI 23-67)以及脾脏和肝脏和肝脏IB的FNA(40%，95%CI 19-62)。

结论和相关性：在这20只FIP猫中，每只猫至少有一份组织或液体样本中均发现了S基因突变的FCoV。这点强调了突变S基因与系统性FCoV扩散之间的关联。检查不同样本的组合可提高发现S基因突变的FCoV的概率。

关键词：FCoV；FIP；IHC；RT-PCR；S基因；免疫组化

文献来源：Emmler L, Felten S, Matiasek K et al. Felinecoronavirus with and without spike gene mutations detected by real-time RT-PCRsin cats with feline infectious peritonitis J Feline Med Surg. 2020 Aug;22(8):791-799. doi:10.1177/1098612X19886671. Epub 2019 Nov 15.