mRNA定位数据库

mRNA的定位是一种进化上保守的现象，它控制着许多重要的生物学过程，mRNA的功能与其在细胞中的定位密切相关。而开发有效的计算模型以预测真核mRNA的亚细胞定位已成为较为热门的话题，但是现有的最新模型在预测准确性和泛化能力方面仍然存在部分缺陷。

所以今天小编就给大家推荐一款更能精确预测mRNA亚细胞定位的数据库：mRNALocater（http://bio-bigdata.cn/mRNALocater）。我们根据链接打开官网如下，整个页面是相当简洁明了的。

该数据库是一个用于精确表达真核mRNA亚细胞定位的全面、先进的模型。使用XGBoost、LightGBM和CatBoost等算法，基于最优特征子集构建了三种性能相对稳定的不同机器学习模型。mRNALocater是这三个模型的集成，对于某些亚细胞定位预测，它的性能优于最新的mRNALoc（一个mRNA亚细胞定位预测工具）。独立的测试数据集证明，mRNALocater是一个全面而先进的预测工具。

下图为该数据库的基本流程图。

好啦，介绍完该数据库的基本信息，那后面具体的检索过程就相当简单了。下面小编就用示例数据来简单操作描述一下。

点击菜单栏的Services，进入搜索页面，如下图所示：我们在空白框内粘贴目的基因的FASTA序列或者在Upload a File 处上传目的基因的FASTA格式的文件。点击提交。

（点击重置按钮可以进行新的检索）

提交后，具体的检索结果如下图所示，以表格形式显示，当然我们也可以点击

切换数据呈现模式。

该结果总共提供了五个亚细胞定位的预测分数，最终具体准确定位以最高分数为准。

点击

，我们也可以很轻松下载不同格式的结果数据。

好啦，该数据库的使用就介绍到这里，具体操作是很简单的，就是输入，提交，查看结果。

这里主要是给大家提供一个新的数据库，以后使用的时候可以货比三家嘛~