基准医疗范建兵博士：携手Twist，共同打造甲基化泛癌检测产品，填补国际市场空白
基准医疗(AnchorDx)与美国著名基因公司Twist Bioscience（拓维斯特，纳斯达克股票代码：TWST，以下简称“Twist”）联合开发的用于泛癌种研究的甲基化文库制备和靶向富集的NGS测序产品 — 拓维思特-基准甲基化泛癌检测（以下简称“甲基化泛癌检测产品”）已于9月24日（美国时间）在全球上市（点击原文：基准医疗与Twist Bioscience联合开发的泛癌种甲基化产品全球上市）。这款泛癌种甲基化检测产品填补了泛癌甲基化液体活检的国际市场空白，为科研机构和行业用户提供研发泛癌种液体活检产品的利器。基准医疗选择跨洋携手Twist，强强联合，共谱佳话，成为了行业间国际合作的典范。
早筛网采访了基准医疗首席执行官兼创始人范建兵博士。范建兵博士分享了基准医疗和Twist合作的故事，并详细讲解了甲基化泛癌检测产品的优点、解决的难题、以及应用前景。
早在2016年基准医疗（AnchorDx）就开始利用拓唯思特（Twist）的探针合成平台构建了多个与癌症相关的panels，进行了大量的前期生物标志物的发现和临床验证工作，并不断在癌症早诊早筛产品开发中取得了诸多可喜的突破，比如开发出了基于血液的无创肺结节良恶性诊断产品PulmoSeek，相关研究成果也发表在国际权威杂志《Journal of Clinical Investigation》上。基准医疗作为中国第一家致力于将ctDNA甲基化高通量测序技术应用于肿瘤早诊的公司，我们对前期的开发基础有着非常严谨的科学要求。之所以选择Twist，是因为Twist在探针设计和合成上有着世界一流的优越品质，符合我们前期研发的高标准需求。而在过去几年的合作中，Twist也十分认可基准医疗扎实认真的科学态度和丰富经验，及其在早诊早筛领域的全球影响力。于是，双方在2019年初便很自然地达成了合作开发产品的意向，以期携两家之所长，共同打造出一款可用于泛癌种研究的甲基化文库制备和靶向富集的NGS测序产品，填补国际市场上的一个空白。经过两年时间的共同研发，我们很高兴看到这款产品在今年9月推向了全球市场。
这款泛癌种甲基化检测产品具备覆盖面广、实验操作和数据分析流程化、检测效率高等优点。它涵盖了47个TCGA（The Cancer Genome Atlas，癌症基因组图谱）疾病类型，包括31种癌症。首先，它融合了基准医疗自主产生的、以及从TCGA公共数据库中精选出来的与多种癌症相关的甲基化markers；我们已经在大量临床试验中验证了这些markers 在多种癌症中的有效性。另一方面，它整合了Twist在探针设计、DNA合成上的技术优势和质控优势，再加上快速高效的靶向杂交和富集，可确保在大规模筛查应用中具备稳定均一的高性能。
这款产品可用于研究多种癌症的发生、发展和转移等过程中的基因调控（甲基化水平），同时也可为基因检测公司开发癌症早筛、早诊、预后、复发监测产品提供高效可靠的研发工具。所以，不管是科研用户还是工业用户，应该都会对它或多或少有所需求。
我在 Illumina 工作时，曾组织开发了广受业界好评的 450K(甲基化)芯片。我们与Twist 合作开发的这个泛癌种甲基化产品也是基于同样的思考和初衷，就是为广大研究者赋能，为他们提供技术先进、实验高效、性价比高的的基础研发平台。
工业用户可以使用这个产品，直接跳过早期生物标志物筛选这一庞杂步骤。虽然这个步骤是癌症早检产品开发过程中重要的科学基础，但也仅仅是万里长征第一步；要做出真正有临床价值的产品，更大的挑战是真实世界大规模前瞻性的临床验证。基准医疗有着深厚的技术和产品开发经验，我们在自己选定的几大高发癌种（比如肺癌、乳腺癌、消化系统癌症和泌尿系统癌症）上已经钻研了数年，早早发力于多个真实世界大规模前瞻性临床试验，验证各个产品的泛化能力，诸多科研成果也已陆续发表于多个国际知名医学期刊上。
癌症早诊早筛是一项伟大的事业，任何单一国家、单一团体 或公司都无法独立完成这项工作。我们希望借着这个产品，与全球各地的研究者在不同的维度展开合作，共同促进癌症早诊早筛研究的蓬勃发展，力求打造出更多先进的癌症检测技术和产品，造福全人类。
目前基准医疗的业务重心仍是在早筛早诊领域，尚未考虑向上游延伸。
根据我们和 Twist 的调研，全球范围内目前尚无类似的泛癌甲基化液体活检产品。它的优势主要在于它兼顾了癌症研究的方方面面：1）Panel 选择的权威性，涵盖面广；2）可检测超低丰度的甲基化变化；3）可检测组织样本，也可检测血液样本；4）可与其他文库制备方法无缝对接，这样，研究者可使用以前的文库样本，而无需动用新的血液样本。
在癌症早筛领域，存在两种不同的策略。一种是Top-down策略，以美国GRAIL公司为代表，即开发覆盖“全”癌种的早筛检测；第二种是Bottom-up策略，以基准医疗为例，即开发单个或少数几种高发癌种的早筛检测，并在不同癌种的检测方法之间保留着可以简便组合的灵活性。
Top-down策略可以覆盖整个癌症的早筛市场，但可能存在性能比较差的缺点, 因为在同一检测条件下，很难兼顾到不同癌症检测的不同需求。另外，要完成真正意义上的所有50多个癌种检测的临床验证，需要庞大的组织机构、巨大的人力物力财力、漫长的时间。Bottom-up策略可以更精准地针对特定的一种或几种高发癌症，开发周期短，性能会相对比较好一些。
在可预见的将来，这两种策略会相互并存相互促进， 并逐渐接近、靠拢。无论是国内还是国外，今后都会涌现出不同的泛癌种、单一癌种或多癌种早筛的产品，竞争将会非常的剧烈。但任何一个有生命力的产品都一定要兼顾到：临床价值，准确性，卫生经济学和社会经济效益，检测的可及性，与现有医疗体系的整合。我们一定要找准临床痛点，让癌症早筛早诊落到实处。