荷兰发现新冠病毒新支,对探寻COVID-19起源有新的重大线索
昨天GISAID数据库新增40多例全基因组数据,主要来自荷兰和澳大利亚的样本。荷兰的数据很有意思,大部分是在北欧爆发主簇里面(从德国传播开),但是有11例单独成簇,其根部直接与目前最早一例武汉2019/12/24日样本关联,从而把感染时间推断到2019/12/20号。昨天我还在说武汉2019/12/24日样本支系可能被扑灭,现在看来没有。该簇第二早样本则是美国加利福尼亚州1月27日病例,由加州公共卫生部提供。
图1和图2是辐射雷达图。可以看到欧洲1、欧洲2、大洋洲和荷兰独立支(暂算欧洲3支吧。)。
图3是无根树,图4是矩形图,图5是时序图。显示一个共同源头先分出两支,一支包括2019/12/24日武汉01样本(已经发生3步突变?)和3例荷兰样本,另外一支包括2020/1/27日美国加州样本和8例荷兰样本。所以这个传播关系就非常微妙!
荷兰这一支的出现,对探寻新冠病毒起源和传播又有新的重大意义和重要线索。
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