蛋白组学数据处理之PPI互作分析
先吐槽一下自己:从公众号申请到现在,两年发了5个动态。立个Flag,2020年接下来发10个动态
。
PPI互作分析用到的工具:
STRING数据库+Cytoscape软件
STRING数据库(https://string-db.org/)作为一个在线的已知蛋白互作分析工作,非常简便好用。截止到这篇文章日期,已经更新到11.0版本,涵盖了5090个物种,囊括24.6 mio 种蛋白,收录了>2000 mio 个蛋白互作信息(有图有真相👇)。
点击SEARCH按钮,进入搜索界面:
红框中的内容,
本人常用的只是“Protien by name”,“Multiple proteins”,主要讲一下后者,用于多个指标互作分析。
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