转染过程中许多因素会影响转染效率:如细胞种类、细胞密度;质粒大小、质粒纯度;血清;抗生素;转染试剂等。转染实验中,以下几个因素需多加注意。1. 转染前的细胞状态和密度转染时细胞密度以 70~90%(贴壁细胞)或 2×106~4×106细胞 / mL(悬浮细胞)为宜,细胞密度过高会严重影响细胞状态(周期进程阻滞,凋亡增加等)。转染效率随着细胞传代次数不同会发生很大变化,因为传代次数少的细胞转染率非常低,而对传代次数较多的细胞而言,其转染最佳剂量差别较大。同时支原体污染会严重降低细胞的转染效率,因此转染前可用环丙沙星处理细胞以除去支原体。2. 转染时的质粒纯度假使质粒不纯,如带少量盐离子,蛋白、代谢物污染等都会显著影响转染复合物的有效形成;而含有内毒素的质粒对细胞存在很大的毒性作用。抗生素一般对真核细胞无毒,但转染过程中细胞通透性增加,使抗生素进入细胞,从而降低细胞活性,导致转染效率低下。3. 转染后的筛选时间转染后筛选不能太早或太晚,因为转染了外源基因的细胞代谢负荷大,增殖较慢,太晚会被没有外源基因转入的细胞所淹没,最终导致筛选不出阳性克隆。一般要在转染 48 h 之后开始加抗生素筛选。转染流程示意图4. DNA 与转染试剂的比例许多转染方法需要优化 DNA 与转染试剂的比例。不同细胞系转染效率通常不同,细胞系的选择通常根据实验需要确定。在转染前应根据实验要求和细胞特性选择合适的转染试剂,不同转染试剂转染效率差别很大,好的转染试剂能让您事半功倍。