同样是做 PCR,为什么结果总跟师兄差这么多?
实验室里,看看师兄做的 PCR,扩增效率高,电泳条带完美,再看看自己的,辛苦做半天,感觉反应得挺好,结果一测假阳性……问题到底出在哪儿呢?
引物设计没问题啊,操作也很小心,不是模板质量的锅,温度也控制得挺好的……
相信很多伙伴也遇到过各式各样的问题,我们在 PCR 实验中碰壁时,会下意识地去分析反应体系内的因素,但常会忽视实验中耗材也有着重要影响。
你的 PCR 结果不对,PCR 耗材有可能才是本质原因。一方面,耗材微量的污染或抑制剂的引入会造成实验污染;另一方面,耗材选择不当同样也会使实验结果受尽苦难。
问题又来了,PCR 耗材类型众多,像 8 联管、低容管、无裙边、半裙边、升孔缘等一系列的 PCR 及 qPCR 板,如何选择合适的才能让实验更顺利呢?又有哪些需注意的问题……想想就让人头秃~
不用担心,今天小编结合多年经验,整理了 PCR 耗材选择常见问题,希望可以帮助大家,也欢迎小伙伴们留言分享经验或提问哦~
Q1: PCR 耗材为什么一般都是 PP 材质的呢?
BRAND:因为 PCR/qPCR 耗材通常会与试剂或样品直接接触,而聚丙烯(PP)材质是生物学惰性材料,表面不易于粘附生物分子,且有着良好的化学耐性,及温度耐受性(可以 121 ℃ 高压灭菌,也可以承受热循环过程中的温度变化)。
Q2: 不同体积的 PCR 管/板,我该怎么选呢?
BRAND:选择宗旨:依据具体的实验要求选用合适的产品。PCR 管的体积大多数都可以满足 PCR 反应的要求。在此基础上,推荐优先选用低容管。因为低容反应管/板有着较小的上方空间,可提高热传导率并降低蒸发。同时,在加样时需要避免加样过量或过少。过量会导致热传导率下降,溢出及交叉污染,而过少可能会造成样品蒸发损失。
常见反应管的规格及体积:
单管/联管:0.5 mL,0.2 mL,0.15 mL
96 孔板:0.2 mL,0.15 mL
384 孔板:0.04 mL
Q3: 样品量较少时,我会选单管或者联管,但是为什么有的是平盖,有的是凸盖呢?
BRAND:当样品量较少时,都会优先选用单管或者联管。但是当反应体积需求较大时,单管占优势,体积可达 0.5 mL。而平盖和凸盖各有优点,具体可参考下面的信息。
Q4: 不同颜色的 PCR 管/板,我该怎么选呢?
BRAND:对于普通的 PCR 反应选用透明或者彩色的 PCR 管都是可以的,而彩色透明的 PCR 管更有助于进行样品分类管理。
但 qPCR 更推荐选用优质的白色 PCR 耗材。由于 qPCR 需要实时定量检测荧光信号强度,更需要灵敏、精确的荧光信号传递。实验证明,与传统的透明 PCR 产品相比,白色 PCR 产品可最大程度地反射荧光信号,减少孔间信号交叉污染,可优化实时荧光定量 PCR 的结果。
Q5: 我之前买的 PCR 板/管材质厚度不一,是不是厚点的稳定性更好呢?
BRAND:不是的,管壁厚度会直接影响热传导率,极薄的壁厚可优化热传递减少循环时间。要想提升 PCR 反应效率,保证反应稳定高效进行,均一、超壁薄的 PCR 耗材才是不二之选。
Q6: 对于 96 孔或者 384 孔板,为什么有的有裙边,有的没有呢?
BRAND:其实 PCR/qPCR 板的裙边是为了更好地适应自动化应用,可为仪器提供稳定的支持和机械耐受强度,且移液过程中的稳定性也会更高。
PCR 板一般分为无裙边、半裙边、全裙边。
无裙边板:可适用于大多数的 PCR 仪或 qPCR 仪,但不适用于自动化应用。移液过程中稳定性不高,需要配合板托使用。
半裙边板:可适配标签或应用条码,及自动化应用,且有着较好的移液稳定性。
全裙边板:非常适用于自动化实验应用,也可适配标签及应用条码。机械强度较好,可适用于凸出模块的 PCR 仪,且移液过程中稳定性高。
Q7: 对于 96 孔或者 384 孔板,为什么切角和标识都不是很相同呢?
BRAND:这是由切角和标识的作用决定的。
切角:PCR 板的切角位置选择取决于适配仪器要求,便于定位。
标识:PCR 板的数字字母标记有助于识别单个孔及样品位置。一般为凸出的颜色数字标识或者印刻标识。对于一些自动化应用实验,印刻标记的反应板密封性会更好。
Q8: 为什么有的 PCR 板孔是凸出的,有的却是平的呢,哪个更好?
BRAND:适合的才是最好的。常见的 PCR 板有平孔缘和加高孔缘两种。
平孔缘的反应板,可适用于大多数的 PCR 仪。
升孔缘的反应板,便于封膜,可降低样品间的交叉污染风险。
Q9: PCR 封板膜有好多种类型,哪种实验效果更好呢?
BRAND:根据具体的 PCR 实验要求选用适配的高质量封板膜,不仅能有效地保护样品,防止污染,还可以提供可信赖的实验检测数据。
BRAND 提供温度耐受性和密封性强、高透明度、操作简便的高质量 PCR/qPCR 膜。
搞清耗材跳出坑,实验不再有问题。如果大家对 PCR 耗材产品还有其他的疑问,欢迎留言提问或者直接联系我们哦~
▼欢迎扫码咨询▼
BRAND 对于 PCR 产品有着多年的生产及加工经验和行业高标准要求,产品线种类丰富,可以满足绝大多数的 PCR 实验应用,快来选择合适您实验应用的产品吧。
图文来源:BRAND