一例肺鳞癌的基因解读-与中山医院的病理专家的不同解读
这是一例肺鳞癌病例,病人在北京协和做的多基因检测。对此基因检测报告的解读,中山医院病理科的分子检测专家陆教授给的意思是:1、这个肺鳞癌的主要驱动还是在ALK/KDR,PIK3CA的扩增和TP53的突变都是很好的帮凶。2、对付ALK和KDR应该是首选策略,外加打击PIK3CA这个帮凶的控制,将可以抑制肿瘤的生长。建议病人用ALK抑制剂。
而我对此表示很不认同。我们知道肺鳞癌的8个高频突变基因为TP53,KMT2C,NFE2L2,KEAP1,CDKN2A,PTEN,FBXW7,PIK3CA。本次基因检测仅有PIK3CA基因扩增可能具有意义,但按照MD anderson对扩增倍数的定义,CN需要大于6才有意义。所以本次基因检测并没有检测到明确的驱动突变。如果要上靶向药,可以尝试阿法替尼。
ALK常见的突变形式有三个:
接下来我们来看看ALK R1084C错义突变是否是驱动突变?
也就是说ALK R1084C突变属于意义不明的突变。
我们再查询ClinVar上的数据,显示ALK R1084C突变属于功能意义不明的突变。
所以以此突变作为驱动突变是没有依据的。ALK突变相对来说是比较少见的,以融合为主。常见的突变点位见下图
常见gateway mutation:C1156Y I1171N I1171s I1171T F1174C L1196M L1198F G1202R G1202del D1203N E1210K G1269A
ALK点突变是导致crizotinib获得性耐药的一个原因。
https://clincancerres.aacrjournals.org/content/18/5/1472
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