环状RNA方向二区SCI发文思路

今天介绍一种环状RNA方向二区SCI发文思路，作者研究的是xxx环状RNA通过吸附xxx miRNA促进xxx基因的表达激活了xxx信号通路，从而发挥xxx作用（ceRNA调控机制）。这篇文章发表在Cell Death & Disease上，影响因子：6.3，中科院最新分区：二区，属于OA期刊，需要收取版面费，不在中科院发布的国际预警期刊名单上。

文章题目：Hsa_circ_0110757 upregulates ITGA1 to facilitate temozolomide resistance in glioma by suppressing hsa-miR-1298-5p

分析内容：

1、作者收集相关的TMZ-resistant GBM临床样本组织进行RNA-seq测序找出具有差异的环状RNA（TMZ-resistant vs TMZ-sensitive），作者主要对上调的环状RNA比较感兴趣，然后使用RT-PCR进行验证，发现hsa_circ_0110757 的表达上调最显著，并且在相关细胞系中得到验证。

2、通过相关体外实验证实hsa_circ_0110757会促进TMZ resistance。

3、作者通过miRanda、PITA、 RNAhybrid三个网站预测hsa_circ_0110757下游的miRNA，相关实验证据表明hsa_circ_0110757是通过吸附 hsa-miR-1298-5p发挥作用。

4、通过microRNA、TargetScanVert、miRDB 网站预测hsa-miR-1298-5p下游的靶基因，通过相关筛选最后发现ITGA1是hsa-miR-1298-5p下游调控的靶基因。

5、hsa_circ_0110757/hsa-miR-1298-5p/ITGA1这样的ceRNA调控机制已经找到了，然后就是探索ITGA1相关的信号通路，最后发现是PI3K/AKT信号通路，相关的作用机制也就得到了解释：hsa_circ_0110757通过吸附hsa-miR-1298-5p促进 ITGA1的表达激活了PI3K/AKT信号通路，从而促进了GBM的TMZ resistance。

6、通过体内实验证实hsa_circ_0110757会促进TMZ resistance。

上面的内容可以归纳在一张图上，如下图：

总结：ceRNA是近几年的研究热点，虽然现在热度是下降了，不过仍然有很多人在做这样的ceRNA基础科研，因为这样的套路比较成熟，论是实验设计还是相关操作可行性都是比较高的。这篇是通过测序筛选出差异的环状RNA，不过临床样本有点少，只有10个（5 vs 5），与那些一两百个样本的测序筛选差远了。当然这个还要考虑课题组的经费问题，不是每个课题组都有这么多经费测序，也不是每一个课题组都能收集到这么多临床样本。但是有些审稿人并不会考虑这些，而是只会让你补充临床样本测序，如果要是遇到这样的审稿人就麻烦了。除了自己收集临床样本测序进行筛选外，还可以利用GEO数据挖掘的方法筛选或者利用GEO数据来验证也行。