常说的IGHV体细胞高频突变检测,你懂了吗?

慢性淋巴细胞白血病(CLL)/小淋巴细胞淋巴瘤(SLL)CLL/SLL是主要发生在中老年人群的一种具有特定免疫表型特征的成熟B淋巴细胞克隆增殖性肿瘤,以淋巴细胞在外周血、骨髓、脾脏和淋巴结聚集为特征。

在CLL/SLL的治疗中,有一系列与预后相关的生物学指标,其中目前认为最具价值的为免疫球蛋白基因重链可变区IGHV突变状态 ,无论是国际的NCCN指南,还是国内的专家共识,都已将其列为常规的检测项目。

IGHV和TP53突变作为指南推荐指标

1、IGHV和TP53突变在国际CLL-IPI评分系统和国际iwCLL诊疗指南中为推荐必检指标。

2、在NCCN指南中,将IGHV的突变率做了更清晰的划分,以2%为界限,>2%,预后良好,≤2%,预后不良。

3、在2018年的中国专家共识中明确列出,IGHV突变状态与CLL的国际预后指数(IPI)相关,帮助患者预后分层。并且,使用VH3-21 片段的患者,无论IGHV 的突变状态,其预后均较差。

01
IGHV突变和TP53突变

(一)IGHV突变到底是什么意思?为什么突变率高了反而预后好呢?

在早期B细胞发育过程中,IGH基因是由多个多态性基因片段组装而成的,这些片段经历了重排和选择,产生了可变多样性连接(VDJ)组合,这种组合在每个B细胞的长度和序列上都是独特的。

Quantifying evolutionary constraints on B cell affinity maturation McCoy CO, Bedford T, Minin VN, Bradley P, Robins H, Matsen FA. 2015. Phil Trans R Soc B: 370: 20140244.

在淋巴结的生发中心反应过程中,新获得的(体细胞)点突变被引入成熟B细胞的可变(V)区域,即为了提高与抗原结合的效率,B细胞发育成熟后Ig基因会发生突变,主要发生IGHV区,该过程称为体细胞超突变(Somatic Hypermutation, SHM)。突变基因产生的免疫球蛋白更容易结合抗原。这也就是突变率高反而预后好的原因。

(二)TP53突变又是什么?

TP53基因又称为P53,是一种抑癌基因,该基因编码一种分子量为53kDa的蛋白质。细胞中抑制癌变的基因TP53会判断DNA变异的程度,如果变异较小,这种基因就促使细胞自我修复;如果DNA变异较大,TP53就会诱导细胞凋亡。TP53基因的错义突变、插入或缺失造成的失活突变非常常见。TP53的基因突变形式、突变的位点非常复杂,也非常多样性,不大可能完全一致,错义突变更多的降低TP53基因的功能,而无义突变则可能把TP53基因完整地废掉了。

02
SEQ-SHM检测介绍

如何检测IGHV突变和TP53突变?艾沐蒽推出的Seq-SHM®检测方法,通过二代测序(NGS)技术同时鉴定克隆IgH重排、肿瘤特异性重排序列,体细胞突变百分比的测定和TP53基因各突变位点检测,同时加入ImmuHub®技术平台的1700万独立分子标签(Universal Molecular Barcodes, UMB)技术可有效纠正PCR扩增和测序时候产生的核酸错误,获得正确突变信息。

产品优势如下:

  • 比传统的IGHV突变检测准确率更高,信息更全面

  • 能同时获得TP53和IGHV的突变信息

同时获得IGHV和TP53突变信息可帮助临床工作者更好的对患者进行用药指导和预后判断。

样本要求

03
SEQ-SHM检测临床意义

Seq-SHM®检测是实现个体化治疗的重要手段,随着各种药物和治疗手段的出现,精准医疗下的用药指导需要基因突变检测的帮助。

Seq-SHM®检测结果包含两部分:

(1)报告免疫球蛋白重链基因(IGH)可变(V)区DNA中是否存在体细胞超突变。大于2%的突变频率将被报告为已突变。重排中确定的突变百分比和V区等位基因都将包括在报告中。缺乏IGHV区域体细胞高突变(未突变)的B-CLL/SLL患者比IGHV区域体细胞高突变(突变)的B-CLL的预后差得多。

(2)报告TP53基因的突变信息。

通常携带TP53突变的患者预后比为携带此基因突变的患者预后差的多。

参考文献:

1. Hamblin TJ, Davis Z, Gardiner A, et al: Unmutated Ig V(H) genes are associated with a more aggressive form of chronic lymphocytic leukemia. Blood 1999 September 15;94(6):1848-1854

2. Damle RN, Wasil T, Fais F, et al: Ig V gene mutation status and CD38 expression as novel prognostic indicators in chronic lymphocytic leukemia. Blood 1999 September 15;94(6):1840-1847

3. Langerak AW, Davi F, Ghia P, et al: Immunoglobulin sequence analysis and prognostication in CLL: guidelines from the ERIC review board for reliable interpretation of problematic cases. Leukemia 2011;25:979-984

(0)

相关推荐