应用RAD技术构建茄子的遗传图谱并对花青素苷呈色性状进行QTL 定位

研究背景

茄子是第三个最重要的茄科作物（仅次于马铃薯和番茄），在2010年全球产量为41.8 Mt，是中东、东非、南亚地区和欧洲南部的重要蔬菜。通过遗传重组所得到的基因在具体染色体上线性排列图称为遗传连锁图谱。遗传连锁图谱是定位和分析植物和动物的复杂性状的重要资源。

研究目的

利用Illumina的高通量测序平台，采用限制性酶切DNA（RAD）技术，对茄子进行单核苷酸多态性（SNP）的开发，完成其遗传图谱的构建，并对花青素苷呈色性状的数量性状位点（QTL）进行定位。

研究结果

在茄子基因组上共发现了347个新的SNP标记和84个锚定标记，用431个标记中的415个标记构建了相应的茄子遗传连锁图谱。图谱跨越的总遗传距离为1390 cM，包含了12个连锁群。并据此对花青素苷呈色性状进行了相应的定位。结果显示其与七个性状相关，每个性状分别受一至六个数量性状位点（QTL）控制，并且其中至少有一个QTL起着主要作用。

参考文献

Lorenzo Barchi, et al. A RAD Tag Derived Marker Based Eggplant Linkage Map and the Location of QTLs Determining Anthocyanin Pigmentation. PLoS One, 2012, 7 (8) : e43740.