5分+ 不到两个月接收 单基因生信+实验可以这样做

大家好，今天要和大家分享的是2021年3月份发表的一篇文章：“LRH1Acts as an Oncogenic Driver in Human Osteosarcoma and Pan-Cancer”；

研究背景：骨肉瘤（OS）主要发生在儿童和青少年，是一种毁灭性疾病，因易远处转移而预后较差。最近研究表明，肝受体同源物1（LRH-1）在几种人类癌症的转移中起着至关重要的作用，但在骨肉瘤转移中的作用尚不清楚，因此作者主要探索了LRH-1在骨肉瘤中发挥着何种作用。

本研究干湿结合，基于骨肉瘤细胞株的高通量测序，表明LRH-1在细胞迁移、侵袭，血管生成中起关键作用，作者遂开展体外功能实验验证之；此外，作者还对该基因进行相关生物信息学分析。

分析流程：

结果部分：

1.临床样本探究LRH1在骨肉瘤中的表达及其与骨肉瘤临床病理特征之间的关系；

2.体外实验：细胞水平敲低LRH1进行转录组测序，对差异基因进行功能注释，主要富集于细胞迁移、侵袭，血管生成相关通路，并开展体外功能实验验证之；

3.基于测序数据，探究敲低LRH1对EMT和TGFβ信号通路的影响，WB验证相关蛋白改变；

4.对LRH1进行泛癌分析，包括生存预后、共表达基因、蛋白互作网络及启动子甲基化分析;

综上：患者标本免疫组织化学显示，LRH-1蛋白在OS肿瘤组织中的表达明显高于正常骨组织；敲低LRH-1抑制了人源OS细胞的迁移，相关上皮间质化（EMT）指标下调，并且可使转化生长因子β（TGF-β）信号通路失活；敲低LRH-1可抑制人脐静脉内皮细胞（HUVEC）增殖，迁移和血管生成。此外，作者根据利用TCGA数据库，对LRH-1进行泛癌种分析：LRH-1高表达与部分癌种的不良生存预后及EMT通路相关。上述结果表明，LRH-1在人类OS中起肿瘤促进作用，可预测转移潜力，并可作为癌症治疗的潜在靶标。