焦孔素(gasdermins)家族蛋白在细胞死亡与炎症方面的综述
前言
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inflammasome(炎症小体):一种多蛋白信号转导复合物,当检测到宿主来源或病原体来源的危险信号时,炎症小体就会在细胞质开始组装,促进细胞因子的释放,细胞的焦亡型死亡以及炎症。 caspases(半胱天冬氨酸蛋白酶):半胱氨酸依赖性天冬氨酸蛋白酶家族,它作用于底物上特定的天冬氨酸残基,这个家族的酶在细胞死亡和炎症中发挥着核心功能。 necrosis(坏死):细胞死亡方式之一,细胞经历这种死亡形式时,细胞膜丧失完整性,释放细胞成分。 NLRP3:英文全称是Nucleotide- binding oligomerization domain, leucine- rich repeat and pyrin domain- containing 3,即 核苷酸结合寡聚结构域,富含亮氨酸重复序列和含Pyrin结构域3
,这是组装炎症小体的细胞质感受器。NLRP3是一个广谱感受器,它能识别病原体相关和损伤相关分子模式。Pannexin-1 channels(膜联蛋白-1通道):一种细胞膜通道,可以通透离子和小分子代谢物,例如ATP。 NETosis:中性粒细胞的一种特殊死亡方式,其特征是释放DNA,组蛋白和颗粒内容物到细胞外空间。 Liposomes(脂质体):由磷脂组成的,含有至少一个脂质双层的人造球形囊泡。 Mitophagy(线粒体自噬):在营养饥饿或线粒体应激的情况下,通过自噬选择性地去除线粒体。 ASC foci(ASC焦点),英文全称为apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain foci,即 含有caspase募集结构域焦点的凋亡相关斑点样蛋白
,这是一个多聚体蛋白,由炎症小体蛋白的同源寡聚引发的螺旋原纤维形成。Familial Mediterranean fever(家族性地中海热):一种常染色体隐性遗传性自身炎症疾病,由MEFV基因突变引起,该蛋白编码蛋白Pyrin,疾病的特征是自限性发热和浆膜炎(Serositis)。 Pyrin:由细菌诱导的RHO修饰和肌动蛋白细胞骨架动力学破坏的炎症小体形成的细胞质感受器。由MEFV基因编码。 Peroxisomes(过氧化物酶体):真核细胞的过氧化物酶体细胞器参与不同脂肪酸的分解代谢和活性氧的减少。 NLRP1:英文全称为(Nucleotide- binding oligomerization domain, leucine- rich repeat and pyrin domain- containing 1,即 核苷酸结合寡聚结构域,富含亮氨酸重复序列和含1个Pyrin结构域
,这是一个细胞质感受器,组装成炎症小体。它通过N末端规蛋白酶体降解途径(N-end rule proteosomal degradation pathway)活化。NLRC4:英文全称为Nucleotide-binding oligomerization domain, leucine-rich repeat and caspase recruitment domain-containing 4,即 核苷酸结合寡聚结构域,富含亮氨酸重复序列和含caspase募集结构域-4
,一种炎症小体支架蛋白(scaffold protein),与炎症小体感受器(NLR家族凋亡抑制蛋白(NAIP))结合时寡聚化,并形成活化caspase 1的平台。Toll样受体:位于内体和细胞膜上的一类模式识别受体,识别病原体相关和损伤相关的分子模式,并启动信号通路以诱导炎症。
前言
Fig.1:gasdermin家族
Box1:gasdermins的鉴定和表达模式
gasdermin A(GSDMA;也称为GSDM,GSDM1或FKSG9)首先从小鼠皮肤中克隆发现,其表达主要局限于人的食管、膀胱和皮肤的上皮细胞。T淋巴细胞也能表达出可检测到的GSDMA蛋白。小鼠Gsdma1、Gsdma2和Gsdma3的表达也仅限于上皮和皮肤,包括表皮、毛囊和胃。 GSDMB(也称为GSDML,PP4052或PRO2521)是通过使用GSDMA序列作为诱饵进行数据库同源性搜索发现的。GSDMB是gasdermin家族中最具分散特征的成员(另见图1a),它不存在于小鼠和大鼠基因组中,尽管一些啮齿动物物种具有GSDMB同源的序列。GSDMB的表达主要在气道上皮,食道,胃,肝脏,小肠和结肠等组织中也检测到。已经在人类中检测到不同的GSDMB剪接可变体,其中一个转录本编码为GSDMB,在域间连接区(interdomainlinker)(由外显子6编码)中具有caspase 1裂解位点。过表达实验表明,caspase 1可以切割这种异构体并诱导裂解性细胞死亡。 GSDMC(也称为MLZE)首先被鉴定为在转移性小鼠黑色素瘤细胞中表达上调的基因,后来被鉴定为gasdermin家族的成员。小鼠基因组包含四个Gsdmc同源基因。GSDMC的表达仅限于食管、皮肤、脾脏和阴道。人工截短的N端GSDMC(GSDMC NT)能够诱导焦亡,但是什么信号可以激活GSDMC以及如何激活GSDMC仍然不清楚。 GSDMD(也称为GSDMDC1,DFNA5L或FKSG10)首先通过在人类基因组数据库中搜索GSDMA的同源物而鉴定出来的。GSDMD在不同的人类组织以及白细胞的不同亚群中广泛表达。GSDMD直系同源基因仅存在于哺乳动物基因组中,并且都包含一个大的中央结构域,具有caspase 1和小鼠caspase 11或人caspase 4和5的切割位点。然而,值得注意的是,在较低等的脊椎动物,例如斑马鱼中,caspase a(caspy)或caspase b(Caspy2)是人类caspase 1和人类caspase 4或5的同源物,据报道它们能诱导细胞死亡并参与免疫。这表明GSDMD的功能同源物可能存在于这些低等脊椎动物中,尽管不能排除存在其他替代的细胞死亡途径。在哺乳动物中,caspase 1切割前体pro-IL-1β,产生成熟的有生物活性的IL-1β细胞因子。同时,由caspase1、小鼠caspase11或人caspase4或5切割GSDMD导致形成高度裂解的GSDMD NT蛋白片段,其允许释放成熟的IL-1β(Fig. 2)。IL-1β的低级脊椎动物序列缺少保守的caspase 1切割位点,但是,尽管如此,鱼类caspase a,caspase b或IL-1β的抑制在感染期间对宿主是有害的。Gsdmd和pro-IL-1β在哺乳动物中都具有caspase 1切割位点,因此可以赋予炎症小体对IL-1β信号传导的两个关键步骤的调控,即其加工和释放。相比之下,这两个步骤可能由低等脊椎动物中的同源蛋白酶(如caspase a或caspase b)和GSDMD同源物控制。 GSDME(也称为ICERE-1或DFNA5)最初被克隆为常染色体显性非综合征性听力损失的候选基因,后来被发现与gasdermins具有序列和结构上的相似性。GSDME在不同的人类细胞和组织中有不同的表达,包括脑、子宫内膜、胎盘和肠等。在小鼠和人类中,GSDME由caspase 3加工,它直接诱导或在细胞出现凋亡形态后间接诱导焦亡。
GSDME在不同种类的低等脊椎动物中也有表达,例如,GSDME的两个同源基因(GsdmEa和GsdmEb)可以在硬骨鱼(bony fish)中找到。Caspase 3切割位点在斑马鱼GsdmEa中存在,但在GsdmEb中不存在,这表明GsdmEa可以被认为是GSDME的功能同源物。目前尚不清楚GsdmEb是否由鱼类Caspy或caspy2加工,但如果是这样,GsdmEb可能作为哺乳动物GSDMD的功能同源物(见上文)。有趣的是,斑马鱼中GsdmEb的缺失会导致耳朵的半规管畸形,这表明GsdmEb可能导致与人类GSDME相关的听力损失。Pejvakin(PJVK;也称为DFNB59或GSDMF)是另一种与耳聋相关的突变蛋白,但最初是从人类睾丸中克隆得到的。PJVK与GSDME高度相似,PJVK同源基因存在于早期脊椎动物和无脊椎动物中,这表明gasdermin蛋白家族可能是从这些祖先进化而来的。PJVK在睾丸中表达较高,但在其他组织中也广泛表达,包括内耳的毛细胞和听觉系统的其他细胞(TABLE 1)。到目前为止,还不清楚PJVK是否能够被蛋白酶处理,以及它的N末端或全长PJVK是否形成膜孔。
Fig.2:gasdermin D的经典和非经典炎性小体活化
A. 模式识别受体例如pyrin,AIM2,NAIP-NLRC4,NLRP3和NLRP1产生信号后,炎症小体复合物就会组装起来。这识别受体能识别PAMP,内源性危险信号或细胞死亡,损伤或感染引起的细胞稳态改变。
这些受体通过同型或异型PYD/CARD(caspase活化和招募结构域)相互作用来招募含有caspase募集结构域(ASC)的衔接蛋白凋亡相关speck样蛋白的,从而进一步招募pro-caspase 1或直接招募pro-caspase 1。caspase 1在炎症小体中被活化,并且caspase 1加工gasdermin D(GSDMD)以及pro-IL-1β和pro-IL-18等细胞因子。当细胞膜被GSDMD孔通透化时,细胞经历溶裂解、促炎性细胞死亡(焦亡),促进成熟的IL-1β和IL-18的释放。在没有细胞裂解的情况下,GSDMD孔还可以直接释放细胞因子,如IL-1α,危险分子,如高迁移率族蛋白-1(HMGB1),甚至包括caspase 1在内的整个炎症复合物。
TABLE 1:gasdermin表达谱
gasdermin活化
Fig. 3:gasdermin被凋亡型caspase诱导的活化
gasdermin的孔形成机制
Fig.4:gasdermin膜的插入和孔形成机制
gasdermin孔形成后的结果
亚溶解孔形成
焦亡型细胞死亡
Fig.5:gasdermin孔形成以及焦亡的免疫学结果
A. 如果gasdermin孔被修改并终止了gasdermin活化信号,那么细胞内容物的释放可能是短暂的,并且仅限于能够穿过gsdermin孔的小分子(损伤相关的分子模式(DAMP))。
B. 在病原体或激活NF-κB的损伤相关信号存在的情况下,核苷酸结合寡聚结构域、富含亮氨酸重复和含Pyrin结构域的3(NLRP3)炎症小体就会活化焦亡,并与caspase 1的活化和促炎细胞因子(IL-1β,IL-18)的释放以及穿过gasdermin毛孔的小细胞内蛋白(DAMP)有关。在这种情况下,如果没有修复细胞膜上的gasdermin孔,则随着促炎细胞因子释放的激增,以及大量细胞内成分(如炎症小体寡聚体)的释放,最终会以导致促炎性焦亡。因此,焦亡最有可能导致不同的免疫学结果,导致低水平或高水平的炎症反应。
Box 2:焦亡:一种由gasdermin诱导的坏死型细胞死亡
gasdermins在疾病方面的作用
gasdermin A
gasdermin B
gasdermin C
gasdermin D
gasdermin E
Pejvakin
抑制gasdermins与治疗
结论与展望
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