将Dicom格式转换为Nifti文件-方法2

将Dicom格式转换为Nifti文件-方法2

我们要做影像资料后处理分析，需要最常用到的软件是freesurfer、3D Slicer、spm12，但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件，因此我们需要把dicom文件转换成NIFTI格式（analyze格式）。有多种方法可以将Dicom格式转换为Nifti文件，今天为大家介绍一种比较科研的方法。PET，MR，CT等数据都可以用这种方法处理。

一、程序准备：

• 需要软件：SPM12

• 下载地址：https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/

• 安装方法：解压后即可，只需要在Matlab平台下添加路径即可

• 注意事项：请下载与自己电脑操作系统对应的版本

• Matlab安装方法请大家自行百度

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spm12操作视频，请全屏观看

二、操作方法：

1. 准备好需要转换的dicom文件夹，

2. 打开Matlab,在命令行窗口输入spm来启动程序，进入menu界面，

3. 点击  DICOM Import 按钮，进入Batch界面，

4. 点击 DICOM files 选项，找到需要转换的dicom文件夹，打开以后选取全部文件

5. 再点击上方RUN启动按钮，几十秒钟后即可获得Nifti格式的文件，

6. 如果文件夹里有多个序列的图像，软件会自动区分，生成多个Nifti文件

Menu界面

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Batch界面

转换操作视频，请全屏观看

三、小提示：

1. Nifti文件转换完成以后会保存在工作路径下

1. 工作路径修改方法：在这里更换目录路径后，工作目录同时修改

1. 添加SPM时请选择 添加文件夹 ，添加并包含子文件夹可能会出错

1. 选择项目时，点击右键可以全选Select ALL

1. 该方法目前不能处理DTI文件，可以换用dcm2niigui来完成，具体方法可以参考上一篇 将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1

1. 转换完成后请务必确认图像无误

   

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