Linux可以使用Windows特有的NTFS区分磁盘
很简单,就是我个人电脑安装了Windows和ubuntu双系统,然后把之前Windows下面的D盘(Windows特有的NTFS区分磁盘)挂载到了ubuntu,发现,虽然ubuntu这样的Linux系统是可以使用Windows特有的NTFS区分磁盘的,但是没办法chmod它。
绝大部分读写程序,都不会涉及到chmod命令,所以如果我没有运行10x的cellranger count 流程,也不会发现这个问题。Linux可以使用Windows特有的NTFS区分磁盘,确实没有问题,读写都是ok的,但是没办法chmod里面的文件,这个就很尴尬了。
解决方案
购买单独的另外的8T硬盘, 挂载在我个人电脑上面,这个时候注意分区选择EXT4,就完美解决问题啦。
或者,把原有的Windows下面的D盘(Windows特有的NTFS区分磁盘),分出一个3T来,然后设置它这个分区的文件系统为EXT4也可以。
可以看到,下面的两个硬盘就是完全不一样的分区方案。
既然我们的500Gb的固态硬盘可以分成那么多不同花样的区,理论上我们的8T机械硬盘也应该是如此。
对8T机械硬盘进行分区操作
parted命令 是由GNU组织开发的一款功能强大的磁盘分区和分区大小调整工具,与fdisk不同,它支持调整分区的大小。
作为一种设计用于Linux的工具,它没有构建成处理与fdisk关联的多种分区类型,但是,它可以处理最常见的分区格式,包括:ext2、ext3、fat16、fat32、NTFS、ReiserFS、JFS、XFS、UFS、HFS以及Linux交换分区。
前面,我们看到其中一个分区直接就占满了这个8T硬盘:
(parted) print
Model: ATA ST8000NM000A-2KE (scsi)
Disk /dev/sda: 8002GB
Sector size (logical/physical): 512B/4096B
Partition Table: gpt
Disk Flags:
Number Start End Size File system Name Flags
1 17.4kB 16.8MB 16.8MB Microsoft reserved partition msftres
2 16.8MB 8002GB 8002GB ntfs Basic data partition msftdata
(parted) mkpart xfs 50% 100%
Warning: You requested a partition from 4001GB to 8002GB (sectors 7814026583..15628053167).
The closest location we can manage is 8002GB to 8002GB (sectors 15628050432..15628053134).
这样的话,我们根本就没办法使用8T磁盘了。
减少分区大小是非常危险的操作
分区名称后面的(p)代表基本分区,(e)代表扩展分区,(l)代表逻辑分区。
因为我的8T硬盘里面有2T的数据,所以强行划分的话,我希望是4T拿出来,做了下面的的危险操作:
(parted) resize 2
Error: The resize command has been removed in parted 3.0
(parted) resizepart 2
Warning: Partition /dev/sda2 is being used. Are you sure you want to continue?
Yes/No? yes
End? [8002GB]? 4000
Warning: Shrinking a partition can cause data loss, are you sure you want to continue?
Yes/No? yes
警报:数据丢失!!!唉,真的伤心,本来以为是
然后空余成立的4T硬盘位置就可以新建分区啦!
mkpart xfs 4000MB 100%
quit
关于文件系统:
ext2/3/4:是适合Linux的文件系统类型,由于ext3文件系统多了日志记录功能,因此系统恢复起来更加快速,ext4是ext3的升级,效率更加高,因此建议使用默认类型ext4类型,而不要使用ext2/3; xfs:也是一个文件系统类型,在centos7中将被作为默认的文件系统类型,替换ext4。
后来我发现自己分区也写错了,应该是4000G写成了 4000MB 。
检查分区
sudo fsck -t ext4 /dev/sda4
fsck from util-linux 2.34
e2fsck 1.45.5 (07-Jan-2020)
ext2fs_open2: Bad magic number in super-block
fsck.ext4: Superblock invalid, trying backup blocks...
fsck.ext4: Bad magic number in super-block while trying to open /dev/sda4
The superblock could not be read or does not describe a valid ext2/ext3/ext4
filesystem. If the device is valid and it really contains an ext2/ext3/ext4
filesystem (and not swap or ufs or something else), then the superblock
is corrupt, and you might try running e2fsck with an alternate superblock:
e2fsck -b 8193 <device>
or
e2fsck -b 32768 <device>
实际上我需要首先把这个分区给格式化,但是我已经害怕丢失数据了。
还是乖乖的备份我的数据,然后把这个8T硬盘格式化,一切重新来过了。