极端环境（盐碱性石灰池）中的微生物组研究
波兰学者Agnieszka Kalwasińska等人在《Science of The Total Environment》上发表了一篇题目为《Salino-alkaline lime of anthropogenic origin a reservoir of diverse microbial communities》的文章。该研究提供了一种独特的极端环境的微生物组研究。该研究通过16S rDNA扩增子测序分析不同盐度的石灰样品中细菌和古细菌群落的结构。
研究摘要
本文介绍了一种独特的极端环境的微生物组研究-盐性和碱性石灰，是在Janikowo（波兰中部）生产纯碱和食盐的副产品。该研究选取不同盐度2.3-25.5％NaCl）的石灰池，并通过16S rDNA扩增子测序揭示石灰样品中细菌和古细菌群落的结构。在这种极端环境中发现了令人惊讶的丰富多样的细菌群落。观察到的微生物多样性最重要的地球化学驱动因素是盐度，钙离子，营养素和水含量。盐性，碱性石灰中的细菌和古生菌群落结构与天然盐碱性环境中发现的相似。虽然古生菌对整个微生物群落的贡献低于4％，但是四个古生菌属Natronomonas，Halorubrum，Halobellus和Halapricum构成了盐性，碱性石灰的核心微生物群- 一组OTU（大于古菌总相对丰度的0.1％）存在于研究中的所有样品中。在16S rRNA基因文库中，高比例的新型，未分类的古生菌和细菌序列（未在97％相似性水平上鉴定）表明这些潜在的新属，特别是属于Thermoplasmata中的菌属，都定植在这种独特的环境中。
文中主要图片说明
图1. 采样点的示意图。O：来自苏打生产中的脱盐石灰，Z：来自苏打生产中盐水净化的中盐度石灰，S：来自苏打生产中盐水净化的高盐度石灰。灰色：制造工厂;绿色：回收的沉淀池，黄色：经营池塘;棕色：垃圾填埋场（灰，炉渣，市政）;白色：耕地。
图2. 盐碱性石灰中的细菌群落结构最丰富的a）门，b）纲和c）属。d）细菌属和石灰的物理化学参数之间的相关性。
图3.基于Bray - Curtis相异矩阵的a）细菌和b）古生菌群落组成的NMDS图。
图4. 盐碱性石灰中的古生菌群落结构最丰富的a）门，b）纲和c）属。d）古生菌属和石灰的物理化学参数之间的相关性。
图5.a）细菌和b）古生菌OTU的维恩图。
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