科研|Nature 子刊:慢性肾脏病进展相关的血清代谢物和5-甲氧基色氨酸的抗纤维化作用(国人佳作)

编译:Mendelssohn,编辑:谢衣、江舜尧。

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导读

慢性肾脏病(CKD)引起肾功能的逐渐下降,直至终末期肾病而需要透析或者肾移植。早期CKD通常无明显症状,而发展至终末期才被发现。

我们在日常临床工作中,常以肌酐和蛋白尿来评估病情。但是肌酐会受到肌肉容量、年龄等肾外因素影响。蛋白尿也受到发热、感染等肾外因素影响,而且有些时候CKD缓解情况下蛋白尿仍会持续一段时间,故可能导致不必要的升级治疗。
随着科研技术的发展,在大规模人群中使用高通量和高分辨率的代谢组学分析有助于疾病的代谢通路和生物标志物。所以,研究者相信通过代谢组学可能寻找潜在的生物标志物以更好地诊断和治疗CKD.

论文ID

原名:Identification of serum metabolites associating with chronic kidney disease progression and anti-fibrotic effect of 5-methoxytryptopha

译名:鉴定慢性肾脏病进展相关的血清代谢物和5-甲氧基色氨酸的抗纤维化作用

期刊:Nature Communications

影响因子:12.35

发表时间:2019.04.01

通讯作者:赵英永

通讯作者单位:西北大学 生命科学科学院

实验设计

实验结果

1. 筛选生物标志物

纳入703名受试者(Normal:116; CKD1期: 120; CKD2期: 104; CKD3期: 110; CKD4期:119; CKD5期:134),采集血液标本,使用UPLC-HDMS(超高液相色谱-高清质谱)分析鉴定出25109种成分,经过建模和一系列算法(最小绝对收缩和选择算子、随机森林、支持向量机),选择出5种代谢物:5-methoxytryptophan (5-MTP,5-甲氧基色氨酸),canavaninosuccinate (CSA, 琥珀酸),acetylcarnitine(乙酰肉碱),tiglylcarnitine(甲基巴豆酰肉碱),taurine(牛磺酸)。这五种血清代谢物,乙酰肉碱与肌酐呈负相关;其他四种与肌酐呈正相关(图1)。

图1: 筛选出5种代谢产物区别不同分期的CKD

2.验证生物标志物

上面实验筛选出5种代谢物,接着则以三个研究来验证这5种代谢物是否可以外推到其他CKD患者。

2.1 观察性队列验证

纳入健康人、CKD1期患者、CKD2期患者各30名,检测上述5种血清代谢物。无监督聚类分析、主成分分析、随机森林分类器、支持向量机分析等结果提示: 这5种代谢物可完美区分健康者和CKD1期、2期患者(图2)。

图2:代谢物和临床指标的多元统计分析及外部验证。

2.2 前瞻性纵向队列验证

纳入1248名受试者(eGFR≥60ml/mim·1.73㎡),留取血清标本,随访6年,31名受试者进展至eGFR<60 ml/mim·1.73㎡,对比这31名患者的前后血清中上述5种代谢物水平。结果显示:这5种代谢物的变化趋势与筛选代谢物的结果是一致的(图3a-b)。最小二乘法分析和聚类分析提示:这5种代谢物可将患者肾病进展前后区分开来(图3d-e)。ROC分析提示:5-MTP、琥珀酸、乙酰肉碱的预测准确率很高,尤其是5-MTP(图3g)。

图3:通过纵向队列研究进一步验证了这五种代谢物。

2.3 经药物治疗的队列验证

纳入114名服用依那普利、激素或五苓散治疗的CKD2患者,检测这5种代谢物在接受不同治疗患者中的变化。

首先,依那普利组。依那普利治疗半年前后,eGFR无明显差异;蛋白尿明显缓解;除了Taurine(牛磺酸)之外,其他4种代谢物在接受依那普利治疗后均有明显恢复。ROC分析提示乙酰肉碱曲线下面积大,提示预测准确率最高,其次是5-MTP(图4)。

图4:经依那普利治疗前后对5种代谢物的验证。

第二,激素组。激素治疗后,蛋白尿明显下降;除了tiglylcarnitin(甲基巴豆酰肉碱),其他4种代谢物可明显恢复。ROC分析提示5-MTP、琥珀酸、乙酰肉碱的预测准确率比蛋白尿高(补充材料图3)。

补充材料图3:经激素治疗前后对5种代谢物的验证。

第三,五苓散组。五苓散治疗后,蛋白尿明显降低;除了tiglylcarnitin(甲基巴豆酰肉碱),其他4种代谢物可明显恢复。ROC分析提示5-MTP和乙酰肉碱的预测准确率高; 蛋白尿的预测准确率最高,可能说明早期CKD患者服用五苓散在降低蛋白尿方面比服用依那普利或激素获益更多(图5)。

图5:经五苓散治疗前后对5种代谢物的验证。

3.验证5-MTP的肾脏保护作用

研究者在前面的研究中纳入703名受试者,采集血清进行液相质谱分析,鉴定出25109种成分,筛选出5种代谢物,并通过三个队列研究来验证。文献检索发现:5-methoxytryptophan (5-MTP,5-甲氧基色氨酸是进展性CKD代谢物,且与eGFR相关;对血管损伤有保护作用;抗炎作用已有既往研究证明,但在肾脏方面仍需进一步探索。故,则开始验证5-MTP对肾脏的保护作用。

3.1 动物实验

首先,明确5-MTP的组织特异性。采用单侧输尿管梗阻小鼠模型,比较单侧输尿管梗阻小鼠与假手术组小鼠,检测心、肝、肺、脾、肾、前列腺、脑组织中的5-MTP含量。结果显示:在单侧输尿管梗阻的小鼠中,5-MTP在肾脏组织的下降比心、肝、肺、脾、前列腺和大脑的下降更明显(图6a)。

接着,验证5-MTP的抗炎、抗纤维化作用。使用单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠模型,分为假手术组、UUO组、UUO+5-MTP(10mg/kg)组、UUO+5-MTP(100mg/kg)组。HE染色和Masson染色评估小鼠肾脏的炎症和纤维化情况,结果显示:5-MTP可减轻UUO小鼠肾脏的炎症和纤维化(图6b)。Western-blot和免疫组化法检测炎症因子、细胞保护因子表达,结果显示:5-MTP的肾保护作用与NF-κB通路的抑制和Nrf2通路的活化有关(图6c-f)。免疫组化和Western-blot检测促纤维化标志物的表达情况,结果表明: 5-MTP可减少肾间质中fibronectin、vimentin、collagen I、α-SMA的表达,提高E-cadherin的表达,从而抗肾脏纤维化(图6g-i)。

图6:5-MTP的体内抗炎和抗纤维化作用。

3.2 细胞实验

使用TGF-β(转化生子因子-β)刺激诱导人肾小管上皮细胞损伤,分为①正常组、②5MTP-5umol组、③5MTP-10umol组、④TGF组、⑤TGF+ 5MTP-5umol组、⑥TGF+ 5MTP-10umol组。Western-blot检测炎症因子、抗炎因子的表达;免疫荧光检测NF-κB p65的表达;免疫组化检测促纤维化标志物的表达。结果提示:5MTP对TGF诱导的肾小管上皮细胞有抗炎、抗纤维化作用(图7a-c,g-i)。

使用LPS(脂多糖)刺激诱导人肾小球系膜细胞的损伤,分为①正常组、②5MTP-5umol组、③5MTP -10umol组、④LPS组、⑤LPS +5MTP-5umol组、⑥LPS +5MTP-10umol组。Western-blot检测炎症因子、抗炎因子的表达;免疫荧光检测COX-2、HO-1的表达。结果提示:5-MTP对LPS诱导损伤的肾小球系膜细胞有抗炎作用(图7d-f)。

图7:5-MTP的体外抗炎和抗纤维化作用

4.验证TPH-1是肾脏保护的作用靶点

色氨酸作为人体一种必需氨基酸,色氨酸在色氨酸羟化酶(TPH-1)的作用下生成5-MTP。5-MTP则具有抗炎、抗纤维化的肾保护作用。所以研究者则提出TPH-1是否为肾脏保护的作用靶点。

4.1 细胞实验

第一,由TGF-β诱导损伤的人肾小管上皮细胞(HK-2)和由LPS诱导损伤的人肾系膜细胞细胞(HMC),比较正常细胞与刺激损伤后的HK-2和HMC的TPH-1表达差异。结果提示:肾脏细胞在刺激损伤后的TPH-1表达减少(图8a)。

第二,HK-2和HMC,分为三组:①正常HK-2和HMC;②Si RNA的HK-2和HMC;③TPH-1 SiRNA的HK-2和HMC,比较各组TPH-1的表达。结果提示:TPH-1沉默表达的肾脏细胞的TPH-1表达减少(图8b)。

第三, HK-2,分为三组:①正常HK-2;②TGF诱导损伤的HK-2;③TGF诱导损伤+TPH-1 SiRNA的HK-2。比较三种细胞的促纤维化标志物的表达差异。结果提示:TPH-1表达减少的肾小管上皮细胞,促纤维化标志物表达增多。

4.2 动物实验

第一,与正常小鼠相比,单侧输尿管梗阻小鼠和缺血再灌注小鼠中,TPH-1的表达显著下降。

第二,与TPH-1正常表达的单侧输尿管梗阻小鼠和缺血再灌注小鼠相比,TPH-1过表达的单侧输尿管梗阻模型、缺血再灌注模型小鼠中, 5-MTP明显上调;促纤维化标志物下调;促炎标志物下调。

第三,与TPH-1正常表达的单侧输尿管梗阻小鼠相比,TPH-1敲除的单侧输尿管梗阻模型小鼠,结果提示:促纤维化标志物上调;促炎标志物上调。

因此可知,TPH-1对肾脏保护作用起着关键作用!

图8:TPH-1在肾损伤中的保护作用。

讨论

综上所述,本研究发现5种代谢产物,可用于区分早期CKD患者与健康对照者,并作为早期肾脏疾病的准确生物标志物。这些生物标记物可以作为肾脏疾病现有生化指标的有益补充。在机制上,5-MTP及其调节酶TPH-1的缺失通过激活NF-κB和抑制nrf2通路而导致肾损伤。因此,靶向TPH-1可能成为CKD治疗的一个靶点。

评论

本研究的整个研究思路如下图,通过非靶代谢组学和靶向代谢组学结合(上下纵向)细胞和小鼠模型的分子生物学(左右横线)实验,筛选到5个CKD早期诊断标志物(5-甲氧基色氨酸、琥珀酸、乙酰肉碱、甲基巴豆酰肉碱和牛磺酸),并证明了5-MTP具有抗炎和抗纤维化作用,并进一步证明合成5-MTP的关键酶TPH-1对肾保护起关键作用,可能作为治疗CKD的潜在治疗靶点。

原文网址:https://www.nature.com/articles/s41467-019-09329-0

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