九阴和九阳都是至高无上的武学，那么两种武功对比，谁更强？
九阴和九阳都是至高无上的武学，只是九阳真经是一本纯粹的内功心法，而九阴真经就是集武功之大成的全能百科全书，里面包括九阴神功、九阴白骨爪和白蟒鞭，疗伤法和点穴解穴、摧心掌和大伏魔拳等等众多武学。九阴偏重于招式，练习的人主要有郭靖，而九阳则偏重于内力，练习的人主要有张无忌，侧重点不同，所以单纯的比较起来，难免会有无从下手的感觉，但是只要找到特定的人，就可以比较九阴和九阳的强弱了。
金庸先生的武侠小说体系，武功的强弱是取决于内力的，也就是说一个人的内力越强，那么他的武功就越高。只要内功达到登峰造极的境界，在平庸的武功招式，也能化腐朽为神奇，这里我们就拿萧峰来举例子，萧峰被困于聚贤庄时，曾以太祖长拳对抗少林绝技，太祖长拳不过是普通的招式，根本算不上高明的武功，却能战胜千锤百炼的少林绝技，可见内功的修为对武功的提升有至关重要的作用。九阳神功是至高无上的内功心法，学成之后天下武功招式，皆能信手捏来，初学之时，便能胜过他人十数年之功，端的是厉害无比。
九阴真经中也是有内功心法的，其内功心法为九阴神功，和九阳神功并立，都是至高无上的内功心法，当年射雕大侠郭靖，就是学习了九阴神功后，内力突飞猛进，在射雕结尾时，已经能和东邪北丐打上三百回合了，而在神雕结尾时，其武功造诣已经超越东邪南帝等人，可见九阴神功也是一门不俗的内功心法。当年林朝英创出玉女素心剑法，专克王重阳的全真剑法，王重阳夺得华山五绝之首时，武功已经是天下翘首了，看见林朝英留下的剑法后，即使是当时王重阳的境界，也想不到破解玉女素心剑法的招式，还要再阅读九阴真经之后，才能想出破解的招式，可见九阴真经在招式方面的威力。
这也就是说九阴真经这部秘籍，无论从内功，还是招式上，都是属于顶尖水平的。修炼九阴真经的人比较多，成就比较大的有郭靖、北丐洪七公、南僧一灯大师、神雕侠杨过和小龙女，还有后来的周芷若和黄衫女，而修炼九阳神功的就只有两个人，一个是张无忌，另一个是段子羽，像武当少林和峨眉派，修炼只不过是残缺版的九阳真经，其威力远不如大成版的九阳神功。九阴九阳有两次交手，一次是张无忌和周芷若在屠狮大会上的交手，另一次是张无忌和段子羽在皇宫大院的交手。我们都知道周芷若练习的是速成版的九阴真经，并非真经真正的实力，即便如此，周芷若已经能够技压群雄，让峨眉派在天下英雄面前出尽风头，可见九阴真经的厉害。
张无忌随手翻阅《九阴真经》，读了几页，只觉文义深奥，一时难解，然决非阴毒邪辟的武学，说道：“这经上所载武功，其实极是精深，依法修炼，一二十年之后，相信成就非同小可，若是只求速成，学得一些皮毛，那就害人害己了。”顿了一顿，又道：“那位身穿黄衫的杨姊姊，武功与周姑娘明明是一条路子，然而招数正大光明，醇正之极，似乎便也是从这《九阴真经》中而来。”新修版《倚天屠龙记·第三十九回》
九阴神功修炼速度很慢，不像张无忌的九阳神功，四五年时间就练成了，当日斗酒神僧斗酒胜了王重阳，得阅九阴真经秘籍，读完之后不以为然，认为九阴一味追求以柔克刚，以阴胜阳，远不如阴阳互济之妙，于是以九阴为基础，结合自己的武宗禅道心得，创出了一门九阳真经。事实证明九阳神功比九阴神功更为霸道，并且防御力惊人，能够自动护体，反弹外力攻击，研习之后既身怀绝世轻功，当不弱于世上所有的轻功高手。九阳神功还有一项特殊的技能，就是可以自动疗伤，并且百毒不侵，当时赵敏在绿柳庄给明教众人下毒时，唯有张无忌能够幸免，光明顶上调和六大门派和明教的恩怨，受周芷若一剑口吐鲜血，但是经过九阳神功护体治疗，两三日便可痊愈了，实在是颇为神奇的一门内功心法。
段子羽从小修炼九阴神功和九阴白骨爪，坐上华山派掌门时，已经是江湖上数一数二的高手了，朱元璋为躲避张无忌的追杀，特地请张宇初（天师教教主）和段子羽护驾。段子羽和张无忌正面交手，才有了九阴九阳的高下之分，九阴九阳之中张宇初也是一位强者，实力之下只比张无忌略微逊色，他是天师教张正常的儿子，身怀天雷剑法和天雷掌，脚下先天禹罡步法，朱元璋能让他护驾，足见其实力之强。朱元璋开国之后，大肆屠戮明教中人，打压明教势力，丝毫不把张无忌当初誓言放在心上，明教势力越来越弱，张无忌不得已只有重出江湖，手提屠龙宝刀找朱元璋理论。
哪料朱元璋请来两位高人，段子羽的功夫他在君山见识过，虽已是骇人听闻，较他仍逊上几筹，心下不甚在意。本拟百招之内便可将之拾夺下，哪知他数月之别，勇猛精进，与君山时所比，实是判若两人。剑术之高更是他生平所未见，心下骇然，五六百招后，不得已仗宝刀之力削断剑刃。天师教本以奇人异士最多名显于世，张宇初身为少天师，自亦非同小可，眼见侍卫环立，今日能否全身而退实无把握。《九阴九阳·第十七回》
张无忌凭借屠龙宝刀，才能和段子羽张宇初两人战至平手，单打独斗的话和段子羽实力差不多，也就是说此时张无忌的九阳神功，和段子羽的九阴神功相比，威力是差不多的，只是九阳神功防御力极强，中了张宇初两记天雷掌，仍然没有任何损伤，相比较之下九阳神功就要略胜一筹了。九阴真经里面，内功和疗伤秘法是完全分开的，一旦受伤之后，就需要找个安静的地方专心疗伤了，并且疗伤的时间远远超过九阳真经，如此相比的话，高下就能立判了。
那名侍卫武功虽不弱，但在张无忌一扣之下焉有还手之力，张无忌见抓错了人，正欲随手抛出，张宇初在侍卫背上突发“天雷神掌”，侍卫如枚肉弹疾撞向张无忌。张无忌不虞有此，欲待闪避已然不及，砰的一声，被这侍卫撞退几步，蓦感胸腹火热，低头一看，衣袍已然焦黑，所幸九阳神功护体，未伤到皮肉。那名侍卫中了一记“天雷神掌”，全身焦黑如炭，又在张无忌九阳神功反撞之下，全身骨骼尽成碎片，一个好生生的活人刹时间变成了从火堆中扒出的遗骨。《九阴九阳·第十七回》
段子羽在练习九阳神功之前，实力是不如张无忌的，也就是说段子羽九阴神功大成，也是打不过张无忌的，九阴真经是一部百科全书，而九阳真经更像是一部保护自己的秘籍，相较之下还是九阳比九阴更为厉害，更能提升修炼者的实力。