药物处理细胞系前后转录组数据该如何分析出花来？ / 开普饭

可变剪切(Alternative splicing,AS)是基因转录时,通过组合不同的外显子,形成不同转录本的过程,在生命的信息传递过程中发挥着重要的作用,维持蛋白质多样性的主要机制.在不同组织或者发 ...

都介绍到单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较部分了,10讲就告一段落了,大家可以回看仔细品读.后面的分析其实都是个性化的了,取决于课题设计,假说,生物学背景知识,而且需要学习大量的R包. 既然是个性 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

编译:一个矫情的农民,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读苹果是蔷薇科植物的一员,是世界上温带地区最重要的经济水果作物之一.苹果在成熟过程中伴随着味道.硬度.香气和颜色的巨大变 ...

本文编译自Nature Communications 美国芝加哥大学遗传医学部和人类遗传学系的Yang I. Li等于2019年3月1日在<Nat Commun>上发表题目<Prio ...

免疫治疗已经大大改变的抗肿瘤治疗的格局. 但不可否认的是免疫治疗需要解决的问题还有很多,最急迫的一个就是准确分辨能够从免疫治疗中获益的人群. 对PD-L1.TMB.微卫星不稳定等生物标志物的探索尚不足 ...

*仅供医学专业人士阅读参考每天1分钟,给你肿瘤圈内的专业"谈资"!(如需文献原文,可加小编微信yxj_oncology获取) 要点提示 JAMA Oncol:输卵管卵巢切除术可降 ...

了解我的应该都知道我最近几个月都在奋战一个陌生的领域,单细胞转录组数据处理.真的很有挑战性,笔记累积了一大堆了,但是没有太值得分享的,大多是利用bulk转录组数据处理的经验而已,但是下面这个是单细胞转 ...

那个时候写教程,以软件安装,软件input和output为主,因为觉得新手最容易纠结的就是这些了,但是现在回过头来看,软件安装已经成了小菜一碟,对各种bam/sam/vcf/gtf也耳熟能详,所谓的i ...

看了这么多找融合基因的工具,目前只有这个最方便及靠谱,不仅仅是因为它发表于2017年,更重要的是他可以直接基于STAR比对好的bam文件来做分析,而大多数其它软件,需要从fastq文件开始,都不方便. ...

药物处理细胞系前后转录组数据该如何分析出花来？