蛋白质组学简介？蛋白质组学的详细步骤

1.什么是蛋白质组学

(Marc Wilkins（1994))

A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.

The study of proteins, how they're modified, when and where they're expressed, how they're involved in metabolic pathways and how they interact with one another.

简而言之：蛋白质组就是一个特定的生物系统中（特定时间、空间）存在的所有蛋白质及其相互作用

2.蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系

ORF并不预示一定存在相应的功能性基因

mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应

翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现

3.蛋白质组学的工作流程

  • 样品上质谱，获得Raw data(质荷比+强度）

  • 使用MaxQuant等搜库，获得初始结果（肽段、蛋白信息）

  • 质控得到可信结果（包括修饰等）

  • 定性分析和定量分析

  • 数据注释、数据挖掘、关联功能

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