科研 | Sci. Adv.: 精神分裂症患者的肠道微生物组可调节小鼠的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环和精神分裂症相关行为
编译:十三,编辑:小菌菌、江舜尧。
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精神分裂症(SCZ)是一种破坏性疾病,约影响全球总人口的0.5%-1%。以前,研究人员一直专注于分析人类基因组以确定SCZ的发病机理。对36,000名患者的全基因组关联(GWAS)分析确定了108个SCZ易感基因。但是,已识别的关联基因可能仅占4%。因此,我们还应设法确定非人类遗传因素在SCZ发病中的作用。胃肠道(GI)是一个复杂的生态系统,包含大量驻留微生物。最新证据表明,肠道菌群可以通过“菌群-肠脑”(MGB)轴调节大脑功能和行为。据报道肠道菌群与焦虑,记忆力,认知和运动活动的改变有关。我们最近的研究表明,使用无菌(GF)方法或抗生素调节肠道菌群可能会导致类似抑郁的行为。这些发现突显了肠道微生物群或MGB轴紊乱可能导致精神疾病发作的新可能性。
MGB轴和SCZ之间的关系尚未完全了解。研究表明,肠道微生物组与SCZ之间可能存在关联。流行病学研究表明,产前微生物感染导致患SCZ的风险增加了10到20倍。此外,SCZ经常合并以肠道微生物群落改变为特征的胃肠道疾病。在动物研究中,肠道菌群对于出生后神经,免疫和内分泌系统的发育和成熟至关重要,而这些行为和生理过程在SCZ患者中经常受到损害。这些研究表明,MGB轴的紊乱可能与SCZ的发展有关。
论文ID
原名:The gut microbiome from patients with schizophrenia modulates the glutamate-glutamine-GABA cycle and schizophrenia-relevant behaviors in mice
译名:精神分裂症患者的肠道微生物组可调节小鼠的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环和精神分裂症相关行为
期刊:Science Advance
IF:11.511
发表时间:2019.06
通讯作者:郑鹏
通讯作者单位:重庆医科大学
实验设计
图1 实验流程图
结果
1 SCZ患者的样品内微生物多样性较低
我们在样品中获得了2,905,956个高质量读数,平均长度为439.18。这些reads以97%的序列相似性聚集成864个OTU。韦恩图显示,SCZ和HCs患者分别有56个和64个OTU(图S1A)。样本内系统发育多样性分析表明,与HCs相比,SCZ患者的微生物丰富度指数(Chao)和多样性指数(Shannon)均较低(图1A)。这些发现表明SCZ患者的微生物组成具有较低的样本内多样性特征。
2 SCZ患者表现出肠道菌群改变
为了确定SCZ患者的微生物组成是否与HC受试者的微生物组成显着不同,我们进行了多样性分析,发现两组之间的肠道微生物组成存在明显差异(图S1,图C,图F和图1B)。在门或纲级别,SCZ和HC受试者显示出分离趋势(图S1,G和H)。我们还进行了分析,以确定整体微生物表型是否受到潜在混杂变量的实质影响。患有SCZ或HCs的患者并未根据这些变量进行聚类,表明总体微生物表型受性别或药物的影响很小(图S2,A至C)。为了识别区分HC受试者与SCZ患者的肠道菌群,我们进行了LEfSe分析,确定了77个区分OTU(图1C和表S2A)。与HC受试者相比,SCZ患者中增加了23个OTU,主要属于Veillonellaceae(5),Prevotellaceae(4),Bacteroidaceae(3)和Coriobacteriaceae(2),其余54个OTU在SCZ患者中减少,属于Lachnospiraceae(16),Ruminococcaceae(12),Norank(5)和Enterobacteriaceae(4)。
为了确定与精神分裂症症状严重程度有关的OTU,我们进行了相关分析。Veillonellaceae OTU191与PANSS呈负相关,而Bacteroidaceae OTU172,Streptococcaceae OTU834和两个LachnospiraceaeOTU(477和629)与PANSS正相关。Ruminococcaceae也有两个与PANSS相关的OTU,一个负相关(OTU725),另一个正相关(OTU181)(图1D)。为了确定关键的区分性微生物,我们基于不同肠道微生物的相对丰度进行了逐步回归分析。分析表明,SCZ和HC受试者之间的最显着差异发生在细菌科:Aerococcaceae,Bifidobacteriaceae,
Brucellaceae,Pasteurellaceaeand Rikenellaceae。ROC曲线分析表明,这些微生物能够区分HC受试者的SCZ患者,曲线下面积(AUC)为0.769(图1E),表明SCZ的潜在诊断价值。
图2 SCZ患者的肠道微生物特性
4 SCZ患者的肠道微生物移植诱导GF受体小鼠的SCZ相关行为
为了确定SCZ相关的行为表型是否可能与肠道菌群紊乱有关,我们进行了粪便菌群移植(FMT)实验,并进行了行为学实验。在野外试验中,SCZ组受体小鼠表现出活动过度(图2A)和焦虑减轻(图2B)。在强迫游泳试验中,与HC组受体小鼠相比,SCZ组受体小鼠活动时间显着增多(图2C),表明抑郁症样行为行为减少。Y迷宫测试、社交性测试和社交新颖性偏好测试结果两组之间没有差异(图2D-2F)。与HC组受体小鼠相比,SCZ组受体小鼠对高分贝音(120 db)表现出夸张的惊吓反应(图2G),但两组之间的PPI无差异(图2H)。总的来说,这些行为测试表明,移植了SCZ菌群的小鼠表现出运动亢进,焦虑和抑郁样行为减少,并且惊吓反应增强,这表明SCZ菌群受体小鼠的微生物组成受到干扰与几种内表型特征有关。
图3 SCZ菌群受体小鼠和HC菌群受体小鼠的行为学比较
5 SCZ中肠道菌群氨基酸和脂质代谢紊乱微生物群受体小鼠
图4 宏基因组学确定SCZ菌群和HC菌群受体小鼠之间的KEGG差异途径
进一步进行了非靶向代谢组学研究,发现从SCZ微生物群受体小鼠获得的粪便,血清和海马样品的代谢组学谱与HC微生物群受体小鼠存在显着差异(图S5,A至G)。我们鉴定了两组之间差异表达的代谢产物(表S3,A至C)。测量了中枢神经系统和周围神经系统的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA(γ-氨基丁酸)代谢的差异,我们发现与HC微生物群受体小鼠相比,SCZ微生物群受体小鼠血清中的谷氨酰胺升高,粪便和海马中的谷氨酸(谷氨酸)减少,海马中的GABA升高(图4,A至C和图S6)。两组之间的血清谷氨酸和GABA以及粪便GABA并无差异(图S7,A和B)。HC和SCZ受试者之间这三种代谢产物的显着差异仅出现在大脑皮层,而在小脑或纹状体中却没有(图S7,C至E),从而证实观察到的代谢紊乱仅限于谷氨酸含量高的大脑区域。功能聚类分析表明,这些差异表达的产物与氨基酸代谢密切相关,例如谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环(图4D和图S6),几种氨基酸的转运(图4D和图S6)和脂质代谢(图4D)。总体而言,SCZ微生物群受体小鼠谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环以及氨基酸代谢和转运发生了变化。改变的脂质主要是甘油磷脂,包括磷脂酰乙醇胺(PEs),磷酸丝氨酸(PSs),磷脂酰胆碱(PCs)或磷脂酰肌醇(PIs),这些物质在SCZ组受体小鼠的血清和海马中出现降低(图4D)。宏基因组学和代谢组学结果共同表明,肠道微生物组的改变可能通过MGB氨基酸和脂质代谢途径与SCZ病理生理学相关。
图5 粪便、血清和海马中代谢物的变化
讨论
肠道菌群可通过MGB轴影响大脑功能和行为,因此可能诱发各种神经精神疾病。在这里,我们发现SCZ患者相对于HC受试者的肠道菌群发生了显著的变化。我们确定了与SCZ严重性密切相关的独特细菌类群。此外,一个特定的微生物检测组能够区分HC受试者与SCZ患者,AUC为0.769。我们用人SCZ患者菌群移植诱导了GF小鼠出现SCZ相关的行为变化。与这些行为变化一致,接受SCZ患者肠道微生物的受体小鼠表现出氨基酸和脂质代谢(包括谷氨酸)紊乱,这与SCZ病理变化密切相关。我们的发现支持肠道微生物群改变可能通过调节MGB代谢途径而参与SCZ发病和/或病理变化。
我们提供了开创性的证据,即SCZ与肠微生物群组成的变化有关,这些变化既是SCZ特有的,又与症状的严重程度有关。此外,我们发现,由于人类SCZ粪便微生物群转移至小鼠而引起的肠道菌群变化,导致低谷氨酸和SCZ相关行为的产生,并伴有肠脑轴代谢的变化。我们的发现为通过MGB轴了解SCZ的机制提供了一个新颖的思路,并可能指导新的诊断和治疗策略。
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