科研 | Sci. Adv.: 精神分裂症患者的肠道微生物组可调节小鼠的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环和精神分裂症相关行为

编译:十三,编辑:小菌菌、江舜尧。

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导读

精神分裂症(SCZ)是一种破坏性疾病,约影响全球总人口的0.5%-1%。以前,研究人员一直专注于分析人类基因组以确定SCZ的发病机理。对36,000名患者的全基因组关联(GWAS)分析确定了108个SCZ易感基因。但是,已识别的关联基因可能仅占4%。因此,我们还应设法确定非人类遗传因素在SCZ发病中的作用。胃肠道(GI)是一个复杂的生态系统,包含大量驻留微生物。最新证据表明,肠道菌群可以通过“菌群-肠脑”(MGB)轴调节大脑功能和行为。据报道肠道菌群与焦虑,记忆力,认知和运动活动的改变有关。我们最近的研究表明,使用无菌(GF)方法或抗生素调节肠道菌群可能会导致类似抑郁的行为。这些发现突显了肠道微生物群或MGB轴紊乱可能导致精神疾病发作的新可能性。

MGB轴和SCZ之间的关系尚未完全了解。研究表明,肠道微生物组与SCZ之间可能存在关联。流行病学研究表明,产前微生物感染导致患SCZ的风险增加了10到20倍。此外,SCZ经常合并以肠道微生物群落改变为特征的胃肠道疾病。在动物研究中,肠道菌群对于出生后神经,免疫和内分泌系统的发育和成熟至关重要,而这些行为和生理过程在SCZ患者中经常受到损害。这些研究表明,MGB轴的紊乱可能与SCZ的发展有关。

论文ID

原名:The gut microbiome from patients with schizophrenia modulates the glutamate-glutamine-GABA cycle and schizophrenia-relevant behaviors in mice

译名:精神分裂症患者的肠道微生物组可调节小鼠的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环和精神分裂症相关行为

期刊:Science Advance

IF:11.511

发表时间:2019.06

通讯作者:郑鹏

通讯作者单位:重庆医科大学

实验设计

图1 实验流程图

结果

1 SCZ患者的样品内微生物多样性较低

我们在样品中获得了2,905,956个高质量读数,平均长度为439.18。这些reads以97%的序列相似性聚集成864个OTU。韦恩图显示,SCZ和HCs患者分别有56个和64个OTU(图S1A)。样本内系统发育多样性分析表明,与HCs相比,SCZ患者的微生物丰富度指数(Chao)和多样性指数(Shannon)均较低(图1A)。这些发现表明SCZ患者的微生物组成具有较低的样本内多样性特征。

2 SCZ患者表现出肠道菌群改变

为了确定SCZ患者的微生物组成是否与HC受试者的微生物组成显着不同,我们进行了多样性分析,发现两组之间的肠道微生物组成存在明显差异(图S1,图C,图F和图1B)。在门或纲级别,SCZ和HC受试者显示出分离趋势(图S1,G和H)。我们还进行了分析,以确定整体微生物表型是否受到潜在混杂变量的实质影响。患有SCZ或HCs的患者并未根据这些变量进行聚类,表明总体微生物表型受性别或药物的影响很小(图S2,A至C)。为了识别区分HC受试者与SCZ患者的肠道菌群,我们进行了LEfSe分析,确定了77个区分OTU(图1C和表S2A)。与HC受试者相比,SCZ患者中增加了23个OTU,主要属于Veillonellaceae(5),Prevotellaceae(4),Bacteroidaceae(3)和Coriobacteriaceae(2),其余54个OTU在SCZ患者中减少,属于Lachnospiraceae(16),Ruminococcaceae(12),Norank(5)和Enterobacteriaceae(4)。

3 SCZ中的症状严重程度和诊断的微生物标志物

为了确定与精神分裂症症状严重程度有关的OTU,我们进行了相关分析。Veillonellaceae OTU191与PANSS呈负相关,而Bacteroidaceae OTU172,Streptococcaceae OTU834和两个LachnospiraceaeOTU(477和629)与PANSS正相关。Ruminococcaceae也有两个与PANSS相关的OTU,一个负相关(OTU725),另一个正相关(OTU181)(图1D)。为了确定关键的区分性微生物,我们基于不同肠道微生物的相对丰度进行了逐步回归分析。分析表明,SCZ和HC受试者之间的最显着差异发生在细菌科:Aerococcaceae,Bifidobacteriaceae,

Brucellaceae,Pasteurellaceaeand Rikenellaceae。ROC曲线分析表明,这些微生物能够区分HC受试者的SCZ患者,曲线下面积(AUC)为0.769(图1E),表明SCZ的潜在诊断价值。

图2 SCZ患者的肠道微生物特性

4 SCZ患者的肠道微生物移植诱导GF受体小鼠的SCZ相关行为

为了确定SCZ相关的行为表型是否可能与肠道菌群紊乱有关,我们进行了粪便菌群移植(FMT)实验,并进行了行为学实验。在野外试验中,SCZ组受体小鼠表现出活动过度(图2A)和焦虑减轻(图2B)。在强迫游泳试验中,与HC组受体小鼠相比,SCZ组受体小鼠活动时间显着增多(图2C),表明抑郁症样行为行为减少。Y迷宫测试、社交性测试和社交新颖性偏好测试结果两组之间没有差异(图2D-2F)。与HC组受体小鼠相比,SCZ组受体小鼠对高分贝音(120 db)表现出夸张的惊吓反应(图2G),但两组之间的PPI无差异(图2H)。总的来说,这些行为测试表明,移植了SCZ菌群的小鼠表现出运动亢进,焦虑和抑郁样行为减少,并且惊吓反应增强,这表明SCZ菌群受体小鼠的微生物组成受到干扰与几种内表型特征有关。

图3 SCZ菌群受体小鼠和HC菌群受体小鼠的行为学比较

5 SCZ中肠道菌群氨基酸和脂质代谢紊乱微生物群受体小鼠

FMT后第2周从SCZ微生物群和HC微生物群受体小鼠获得粪便样本。通路富集分析显示,改变的差异KEGG Orthologs(KOs)主要参与33条受干扰的代谢途径。与HC微生物群受体小鼠相比,SCZ微生物群受体小鼠中33条途径中有7条被下调,其余途径被上调(图3和表S2B),并且SCZ微生物群受体小鼠的脂质和氨基酸代谢相关途径出现特征性变化。

图4 宏基因组学确定SCZ菌群和HC菌群受体小鼠之间的KEGG差异途径

进一步进行了非靶向代谢组学研究,发现从SCZ微生物群受体小鼠获得的粪便,血清和海马样品的代谢组学谱与HC微生物群受体小鼠存在显着差异(图S5,A至G)。我们鉴定了两组之间差异表达的代谢产物(表S3,A至C)。测量了中枢神经系统和周围神经系统的谷氨酸-谷氨酰胺-GABA(γ-氨基丁酸)代谢的差异,我们发现与HC微生物群受体小鼠相比,SCZ微生物群受体小鼠血清中的谷氨酰胺升高,粪便和海马中的谷氨酸(谷氨酸)减少,海马中的GABA升高(图4,A至C和图S6)。两组之间的血清谷氨酸和GABA以及粪便GABA并无差异(图S7,A和B)。HC和SCZ受试者之间这三种代谢产物的显着差异仅出现在大脑皮层,而在小脑或纹状体中却没有(图S7,C至E),从而证实观察到的代谢紊乱仅限于谷氨酸含量高的大脑区域。功能聚类分析表明,这些差异表达的产物与氨基酸代谢密切相关,例如谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环(图4D和图S6),几种氨基酸的转运(图4D和图S6)和脂质代谢(图4D)。总体而言,SCZ微生物群受体小鼠谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环以及氨基酸代谢和转运发生了变化。改变的脂质主要是甘油磷脂,包括磷脂酰乙醇胺(PEs),磷酸丝氨酸(PSs),磷脂酰胆碱(PCs)或磷脂酰肌醇(PIs),这些物质在SCZ组受体小鼠的血清和海马中出现降低(图4D)。宏基因组学和代谢组学结果共同表明,肠道微生物组的改变可能通过MGB氨基酸和脂质代谢途径与SCZ病理生理学相关。

图5 粪便、血清和海马中代谢物的变化

讨论

肠道菌群可通过MGB轴影响大脑功能和行为,因此可能诱发各种神经精神疾病。在这里,我们发现SCZ患者相对于HC受试者的肠道菌群发生了显著的变化。我们确定了与SCZ严重性密切相关的独特细菌类群。此外,一个特定的微生物检测组能够区分HC受试者与SCZ患者,AUC为0.769。我们用人SCZ患者菌群移植诱导了GF小鼠出现SCZ相关的行为变化。与这些行为变化一致,接受SCZ患者肠道微生物的受体小鼠表现出氨基酸和脂质代谢(包括谷氨酸)紊乱,这与SCZ病理变化密切相关。我们的发现支持肠道微生物群改变可能通过调节MGB代谢途径而参与SCZ发病和/或病理变化。

我们还发现SCZ患者的微生物组成比HC受试者的多样性更低。一般而言,多样性高被认为是健康状况良好的标志。在这里,较低的多样性表明SCZ患者的总体微生物状况异常。以前,我们发现抑郁症个体与HC受试者之间的肠道微生物组多样性没有差异。本文中患有SCZ的患者与抑郁症患者肠道微生物组的变化有很大不同。这些发现表明SCZ中肠道菌群与抑郁症的菌群特征不同。在这里,SCZ患者的主要特征是Lachnospiraceae(16 OTUs)和Ruminococcaceae(12 OTUs)的相对丰度降低。这两种肠道菌群物种的减少表明SCZ中的微生物状况异常,使用宏基因组学和代谢组学的研究可能进一步定义了这些肠道菌群和其他特定肠道菌群如何影响SCZ。总之,我们的发现具有潜在的临床诊断价值,并具有治疗意义,并为进一步识别SCZ中肠道微生物的“特征性模式”奠定了基础。
我们还证明,与接受HC受试者微生物的小鼠相比,SCZ患者组受体小鼠引起肠道微生物组成和SCZ相关行为表型的变化。在SCZ相关的小鼠模型中观察到的行为表型可能在某种程度上是非特异性的,并且与多种人类精神疾病有关,接受SCZ微生物组的小鼠相对于接受HC微生物组的小鼠活动过度,在这些行为测试中,活动过度是整个研究中最一致的发现之一。我们还观察到惊吓反应显着增加。此外,社交互动和听觉惊吓的PPI在SCZ和HC微生物组小鼠之间没有显着差异,这表明肠道微生物组的改变与SCZ小鼠模型的某些内表型有关。总之,这些结果表明,SCZ微生物组诱导模型与其他公认的SCZ啮齿动物模型具有许多共同特征。这些行为学结果,以及代谢组学和宏基因组学数据表明,SCZ微生物组粪便移植会造成与SCZ相关的行为途径(尤其是谷氨酸途径)的变化。
我们确定了大脑谷氨酸减少、谷氨酸-谷氨酰胺-GABA循环破坏以及氨基酸和脂质代谢紊乱是可能是SCZ微生物群受体小鼠行为改变的基础。谷氨酸能神经传递,尤其是海马谷氨酸含量降低与SCZ的病理生理密切相关。在SCZ微生物群受体小鼠中,观察到海马谷氨酸水平降低以及谷氨酰胺和GABA升高,可能反映了谷氨酸能神经传递的减弱,谷氨酸-GABA增加或GABA分解为谷氨酸减少,谷氨酸向谷氨酰胺的转化增加或谷氨酰胺向谷氨酸的转化率降低,和/或上述任何一种的转运或重吸收改变。接下来我们将试图阐明在谷氨酸-谷氨酰胺-GABA代谢中观察到的变化。在大脑中,我们观察到海马和皮层的代谢紊乱局限性,这些区域是最常受牵连的大脑区域,表明SCZ微生物群移植产生了靶向的致病功能特异性。但是,还需要进一步研究来证实其他富含谷氨酸-谷氨酰胺-GABA的脑区域的代谢紊乱与SCZ密切相关,例如杏仁核。
我们还发现SCZ微生物群与HC微生物群小鼠的MGB轴脂质种类发生了显着变化,尤其是涉及甘油磷脂的代谢。与这些发现一致的是,SCZ患者的血清和脑组织脂质也出现了明显的紊乱。包括PE,PS,PC和PI在内的甘油磷脂是髓鞘和神经元膜的主要成分,并且是突触功能的关键调节因子。我们的结果表明,SCZ与HC微生物群小鼠的这些甘油磷脂及其相关代谢产物通常在海马和血清中减少,而在粪便样品中增加。这些发现表明,SCZ肠道微生物在SCZ微生物群受体小鼠的外周和大脑中导致甘油磷脂含量的降低。为了减轻对实验相关结果的干扰,我们发现,在药物治疗和无药物治疗的SCZ患者中,总体微生物表型的分布没有变化,或者就药物类型而言,表明抗精神病药物治疗不是一个显着的混杂变量,不会影响我们对结果的解释。其次,所有新招募的受试者都患有SCZ,这可能是为什么在药物治疗和无药物治疗的SCZ患者中,整体微生物表型分布没有差异的原因。需要对大量无药患者进行研究,以验证和扩展当前的发现。

我们提供了开创性的证据,即SCZ与肠微生物群组成的变化有关,这些变化既是SCZ特有的,又与症状的严重程度有关。此外,我们发现,由于人类SCZ粪便微生物群转移至小鼠而引起的肠道菌群变化,导致低谷氨酸和SCZ相关行为的产生,并伴有肠脑轴代谢的变化。我们的发现为通过MGB轴了解SCZ的机制提供了一个新颖的思路,并可能指导新的诊断和治疗策略。



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