Nature子刊：蜜蜂肠道微生物群的基因组多样性
瑞士洛桑大学Kirsten M. Ellegaard 和Philipp Engel 于2019年1月25日在《Nature Communications》上发表题目为《Genomic diversity landscape of the honey bee gut microbiota》的文章。该研究使用基因组测序来综合分析蜜蜂肠道微生物群的基因组多样性，分为三个分类水平：种系型，序列离散群体（sequence-discrete populations，SDP）和菌株。
研究摘要
天然微生物群落中基因组多样性的结构和分布在很大程度上还尚未探索。在这里，我们使用宏基因组学来评估蜜蜂肠道微生物群的多样性，这是一个由少数细菌种系构成的群落。我们的研究结果表明，大多数种系都是由序列离散的菌群组成，它们共存于个体蜜蜂中，并显示出特定年龄的丰度谱。相反，这些序列离散群体的菌株存在于单个蜜蜂中。因此，尽管有保守的系统发育型组成，每只蜜蜂在功能水平上都有一个独特的群落。虽然生态分化似乎促进了更高分类水平的共存，但我们的研究结果表明，在菌株水平上，尽管宿主的社会生活方式不同，菌群组装期间的优先效应导致个体化的概况。我们的研究强调需要超越系水平特征来理解该群落的功能，并说明其应变水平分析的潜力。
文中主要图片说明
图1 实验设计和方法概述。
图2 蜜蜂肠道微生物群系统发育的核心基因组系统发育和SDP验证。
图3 在种水平和SDP水平的样品间的群落组成。
图4 老龄蜜蜂的稳定性和平均种群复制率下降。
图5 不同蜜蜂之间的SDP和菌株的多样性不同。
图6 肠道微生物群的功能基因含量因蜜蜂而异。
你可能还喜欢
培训班推荐👇，快来参加，充实自己吧！
赞 (0)